Centrum biomolekul a komplexních molekulových systémů
Centrum částicové fyziky
Centrum laserového plasmatu
Centrum nanotechnologií a materiálů pro nanoelektroniku
Centrum PALS
Společná laboratoř nízkých teplot
Společná laboratoř optiky Univerzity Palackého v Olomouci a FZÚ
Společná laboratoř pro magnetická studia