Eine vorläufige quantitative Auswertung der Ordinationsliste von Klerikern in der Prager Erzdiözese (1395–1416), in: Geist, Gesellschaft, Kirche im 13.–16. Jahrhundert, ed. František Šmahel (= Colloquia mediaevalia Pragensia 1), Praha 1999, s. 214–222

Seminář svatého Václava a konvikt svatého Bartoloměje v Praze na Starém Městě, in: Pražský sborník historický 31, 2000, s. 186–261

Obraz kléru v pražské arcidiecézi v předvečer husitské revoluce na základě zpracování Liber ordinationum cleri (1395–1416), in: VIII. sjezd českých historiků Hradec Králové 10.–12. září 1999, Praha 2000, s. 150–153

Teorie a praxe svěcení kleriků v předhusitských Čechách, Acta Universitatis Carolinae – Philosophica et historica 2, 1999, Z pomocných věd historických XV, Praha 2003, s. 171–181

Kleriker an der Prager Universität am Vorabend der hussitischen Revolution, Jahrbuch für Universitätsgeschichte 6, Berlin 2003, s. 89–106

Liber Ordinationum Cleri 1395–1416, Práce z dějin vědy 6, Praha 2003, s. 165–170

Stopy svatého Jeronýma v Čechách na konci 14. století, in: Evropa a Čechy na konci středověku. Sborník příspěvků věnovaných Františku Šmahelovi, ed. Eva Doležalová, Pavel Soukup a Robert Novotný, Praha 2004, s. 207–220

Sv. Anežka, in: Největší Čech. 100 nejvýznamnějších osobností Čech, Moravy a Slezska, Praha 2005, s. 23–25

Poznámky k dílu Heinze Zatschka, in: Německá medievistika v českých zemích do roku 1945, ed. Pavel Soukup a František Šmahel (= Práce z dějin vědy 18), Praha 2004, s. 353–362

Nadace pro jezuitský seminář a konvikt v Praze jako specifi cký prvek barokní kultury, in: Barokní Praha – Barokní Čechie 1620–1740, Praha 2005, s. 583–587

Srovnání českých a anglických ordinačních seznamů z období pozdního středověku, Český časopis historický 4, 2005, s. 761–800

Historical-Climatological Research in Bohemia nad Moravia in the Second Half of the 20th Century and the Beginning of the 21st Century, Historica 11, Praha 2006, s. 155–163

Výskyt jména Prokop mezi kleriky v Čechách na přelomu 14. a 15. století, in: Historia monastica I. Sborník z kolokvií a konferencí pořádaných v letech 2002–2003 v cyklu „Život ve středověkém klášteře“, ed. Dušan Foltýn za spolupráce Kateřiny Charvátové a Petra Sommera (= Colloquia mediaevalia Pragensia 3), Praha 2005, s. 189–193

Students of Jesuits schools and boarders of Jesuit hostels in the Old Town of Prague and their participation in pilgrimages and other activities of the Virgin Mary and St. Wenceslas devotion, in: Wallfahrten in der europäischen Kultur. Pilgrimage in European Culture, hg. Daniel Doležal und Hartmut Kühne (= Europäische Wallfahrtsstudien 1), Frankfurt am Main 2006, s. 495–500

Odraz éry přemyslovské dynastie v pramenech a literatuře následující lucemburské doby, in: Przemyślidzi i Piastowie – twórcy i gospodarze średniowiecznych monarchii, Poznań 2006, s. 203–212

Eva Doležalová – Jan Hrdina – František Šmahel – Zdeněk Uhlíř, The Reception and Criticism of Indulgences in the Late Medieval Czech Lands, in: Promissory Notes on the Treasury of Merits. Indulgences in Late Medieval Europe, ed. Robert N. Swanson, (= Brill’s Companions to the Christian Tradition 5), Leiden – Boston 2006, s. 101–145

Jméno Hroznata v pozdně středověkých Čechách, in: Světci a jejich kult ve středověku (= Sborník Katolické teologické fakulty Univerzity Karlovy. Dějiny umění – historie IV), Praha 2007, s. 29–35

Pražská židovská obec ve středověku a její mezinárodní kontakty, in: Od knížat ke králům. Sborník u příležitosti 60. narozenin Josefa Žemličky, ed. Eva Doležalová a Robert Šimůnek ve spolupráci s Danou Dvořáčkovou a Alešem Pořízkou, Praha 2007, s. 349–357

Eva Doležalová – Petr Sommer – Dušan Třeštík – Josef Žemlička, The Christianization of Bohemia and Moravia, in: Annual of Medieval Studies at CEU 13, 2007, s. 153–163

Nacionální a náboženské aspekty pohledu na české reformní hnutí 14. a 15. století a husitskou revoluci v západní historiografi i, Cestou dějin 1. K poctě prof. PhDr. Svatavy Rakové, CSc., ed. Eva Semotanová, Praha 2007, s. 63–75

Eva Doležalová – Jaroslav Šebek, Výzkum církevních dějin v Historickém ústavu v mezinárodním kontextu, Bulletin Historického ústavu AV ČR 19, 2007, s. 39–41

Tituly svěcení v pražské diecézi před husitskou revolucí, in: Církevní topografi e a farní síť pražské církevní provincie v pozdním středověku, ed. Jan Hrdina a Blanka Zilynská (= Colloquia medievalia Pragensia 8), Praha 2007, s. 193–197

Eva Doležalová – Zdeňka Hledíková, Die Erforschung der Entstehung und Ausprägung des Pfarreinetzes bis zum Beginn der hussitischen Revolution in der tschechischen Geschichtswissenschaft, in: Pfarreien im Mittelalter. Deutschland, Polen, Tschechien und Ungarn im Vergleich, hg. Nathalie Kruppa unter Mitwirkung von Leszek Zygner (= Veröffentlichungen des Max-Planck-Instituts für Geschichte 238, Studien zur Germania Sacra 32), Göttingen 2008, s. 83–98

Svěcení duchovních v pozdním středověku, in: Sacri canones servandi sunt. Ius canonicum et status ecclesiae saeculis XIII–XV, ed. Pavel Krafl (= Opera Instituti historici Pragae C 19), Praha 2008, s. 591–595

Spolupráce na kolektivních publikacích

John M. Klassen with Eva Doležalová and Lynn Szabo, The Letters of the Rožmberk Sisters: Noblewomen in Fifteenth-Century Bohemia, Cambridge 2001

Multimediální CD-ROM, výstava Karel IV., z Boží milosti císař (prezentace v souvislosti se zahájením výstavy 15. 2. 2006)

Editorka

František Palacký (1798/1998): Dějiny a dnešek, ed. František Šmahel a Eva Doležalová, Praha 1999

Evropa a Čechy na konci středověku. Sborník příspěvků věnovaných Františku Šmahelovi, ed. Eva Doležalová, Robert Novotný a Pavel Soukup, Praha 2004

Verba in imaginibus. Františku Šmahelovi k 70. narozeninám, ed. Martin Nodl a Petr Sommer ve spolupráci s Evou Doležalovou, Praha 2004

Pozdně středověké testamenty v českých městech. Prameny, metodologie a formy využití, Sborník příspěvků z konference uspořádané 30. listopadu 2005 Archivem hlavního města Prahy a Historickým ústavem Akademie věd České republiky, sestavily Kateřina Jíšová a Eva Doležalová, Praha 2006

Od knížat ke králům. Sborník u příležitosti 60. narozenin Josefa Žemličky, ed. Eva Doležalová a Robert Šimůnek ve spolupráci s Danou Dvořáčkovou a Alešem Pořízkou, Praha 2007