Článek v prestižním časopise Nature Genetics.

Genetické mapování pomocí jednonukleotidových polymorfizmů (SNP) a haplotypů u laboratorního potkana

Laboratorní potkan patří mezi nejčastěji používané modelové organizmy. Inbrední kmeny laboratorního potkana byly odvozeny z omezené zakládající populace a genetická variabilita poskytuje výborný zdroj pro korelační analýzy mezi genotypy a fenotypy. Byla zjištěna celková genetická variabilita potkana pomocí téměř 3 milionů nově odhalených SNP. U 167 inbredních kmenů potkana, 2 sad rekombinantních inbredních kmenů a F2 interkrosu byly získány přesné a kompletní genotypy pomocí vybrané sady 20,238 SNP a byly vytvořeny podrobné genetické mapy. Tato data charakterizují populační strukturu inbredních kmenů a ilustrují stupeň vazbové nerovnováhy. Tento nový genetický zdroj je veřejně přístupný.
K. Saar, A. Beck, M.-T. Bihoreau, E. Birney, D. Brocklebank, Y. Chen, E. Cuppen, S. Demonchy, J. Dopazo, P. Flicek, M. Foglio, A. Fujiyama, I. G. Gut, D. Gauguier, R. Guigo, V. Guryev, M. Heinig, O. Hummel, N. Jahn, S. Klages, V. Kren, M. Kube, H. Kuhl, T. Kuramoto, Y. Kuroki, D. Lechner, Y-A. Lee, N. Lopez-Bigas, G. M. Lathrop, T. Mashimo, I. Medina, R. Mott, G. Patone, J-A. Perrier-Cornet, M. Platzer, M. Pravenec, R. Reinhardt, Y. Sakaki, M. Schilhabel, H. Schulz, T. Serikawa, M. Shikhagaie, S. Tatsumoto, S. Taudien, A. Toyoda, B. Voigt, D. Zelenika, H. Zimdahl, N. Hubner: SNP and haplotype mapping for genetic analysis in the rat, Nature Genetics 40:560-566, 2008, IF=25.556

Autor: pravenecbiomed.cas.cz

Článek v prestižním časopise Nature Genetics.
Odhalení distribuce a funkčního významu variability v počtu kopií genů u laboratorního potkana

Článek v prestižním časopise Nature Genetics.
Review: Odhalení osteoglycinu (Ogn) jako genetické determinanty predisponující k hypertrofii levé komory srdeční u potkana, myši a lidí

Článek v prestižním časopise Nature Genetics.
Odhalení renální exprese Cd36 jako genetické determinanty krevního tlaku a rizikového faktoru vývinu hypertenze

Článek v prestižním časopise Nature Genetics
Studium molekulární podstaty závažné dědičné mitochondriální choroby - novorozenecké encefalo-kardiomyopatie.

Článek v časopise Obesity
Chemické deriváty dokosahexaenové kyseliny (DHA) v prevenci a léčbě obezity indukované vysokotukovou dietou u myší

Článek v časopise Diabetologia
n-3 mastné kyseliny a rosiglitazon mají aditivní efekty na syntézu glykogenu ve svalu u myší krmených vysokotukovou dietou

Článek v prestižním časopise Proceedings of National Academy of Sciences of the USA
Risperidon a ritanserin, ale ne haloperidol blokují vliv dizocilpinu v úloze aktivního alotetického vyhýbání se místu.

Článek v časopise FASEB
Exprese genu pro hydrofobní podjednotku c kontroluje množství savčí mitochondriální ATP syntázy in vivo.

Článek v prestižním časopise Oncogene.
Review. Současné poznatky o struktuře FOXO forkhead transkripčních faktorů a mechanismech jejich regulace.

Článek v časopise PLoS Computational Biology
Princip efektivního kódování poprvé potvrzen pro případ čichu

Článek v Neurobiology of Aging
Research article: Průkaz poruch cholinergní neurotransmise v časném stadiu rozvoje patologie u transgenního myšího modelu Alzheimerovy nemoci.

Článek v časopise American Journal of Physiology Endocrinology and Metabolism
Indukce termogeneze ve svalu vysokotukovou dietou u myší: asociace s odolností k obezitě.

Článek v časopise Journal of Pineal Research
Úloha prolinových zbytků ve struktuře a funkci lidského MT2 melatoninového receptoru.

Ocenění v projektu Česká hlava Mgr. Aleny Čížkové
Mgr. Alena Čížková z Oddělení bioenergetiky byla oceněna v projektu Česká hlava v kategorii "Doktorandus".

Ocenění Dr. Stuchlíka
Cena European Brain and Behaviour Society (EBBS 40th Anniversary Award)

Článek v prestižním časopise Gastroenterology
Práce přinesla důkaz existence cirkadiánních hodin v epitelu tlustého střeva laboratorního potkana.

Článek v prestižním časopise Genome Research
Odhalení přímé vazby mezi variabilitou v mitochondriálním genomu a rizikovými faktory diabetu 2. typu u konplastických kmenů

Článek v prestižním časopise PNAS.
Porušená hipokampální rytmogeneze u modelu temporální epilepsie.

Článek v časopise Journal of Biological Chemistry
N-terminální koncová smyčka i křídlo W2 forkhead domény transkripčního faktoru FOXO4 jsou důležité pro vazbu DNA.

Článek v Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics
Průkaz přetrvávající aktivace muskarinových M2 a M4 receptorů podtypově M1 selektivním agonistou xanomelinem.

Článek v Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics
Průkaz přímé aktivace nepreferenčních Gq/11 and Gs G-proteinů prostřednictvím muskarinového M2 receptoru.

Článek v Journal of Chromatography A
Studium posttranslačních neenzymatických modifikací kolagenu metodami CE–MS/MS, HPLC–MS/MS