«FEB MAY OCT » 1 2009 2010 2011 » 17 captures 24 Jul 09 - 7 Jun 14

Close Help

Sylabus kurzu  Praktické základy vědecké práce (B130P16)

Kurz seznamuje s praktickými základy vědecké praxe v moderní experimentální biologii. Je určen zejména studentům druhého a třetího ročníku, kteří hodlají pokračovat ve studiu experimentálních biologických oborů. Detailně budou probírána základní pravidla vědecké práce, plánování a způsoby hodnocení pokusů, zásady práce v biologické laboratoři, vedení protokolů a etická pravidla vědecké práce. Dále budou účastníci obeznámeni s účelnými postupy vyhledávání ve vědeckých databázích a nakládání s takovými údaji. Prakticky budou demonstrovány postupy přípravy vědeckého sdělení ve formě plakátu, přednášky či článku. Hlavní důraz bude kladen na praktickou demonstraci postupů využitelných při přípravě bakalářské či diplomové práce.

Zajišťuje: 130

Stav předmětu: vyučován

Rozsah v ZS: 0/2 Z (hodiny/týden)

Kredity: 2

Platnost: od 2006

Počet míst: neomezen

Vyučující: Petrášek, J.

petrasek@ueb.cas.cz

Termín přednášky pro podzimní semestr 2009: Středa 15:40 v seminární místnosti katedry fyziologie rostlin PřFUK, Viničná 5, 2.patro. První přednáška se koná 7.10. V případě potřeby počítačů se přednáška bude konat v počítačové učebně B5, v úterý v 14:00 a ve středu v 18:10.

Zadání úkolů 1-4 k zápočtu 2009/2010:

Zadání úkolů 1-3, vzor vypracování úkolu 1

Zadání úkolu 4, obecné informace k vypracování úkolu 4

Obsah kurzu podzimního semestru 2008:
 

1. Základní pravidla fungování vědecké práce - text kapitoly v pdf, prezentace v ppt 8.10., prezentace v ppt 15.10.

1.1. Povaha vědecké práce v experimentální biologii
1.2. Pozorování a pokus - základní činnosti experimentátora
1.3. Vědecké instituce a organizace, vědecké konference
1.4. Etické aspekty vědecké činnosti
1.5. Financování vědeckého výzkumu
1.6. Příprava vědeckých projektů a grantů 

2. Praktické postupy zpracování experimentálních dat - text kapitoly v pdf , prezentace v ppt 22.10.

2.1. Základní organizace práce, typy dat
2.2. Průzkumníci souborů, správné ukládání dat
2.3. Tabulkové procesory, statistické programy, editory grafů
2.4. Zpracování strukturních a sekvenčních dat
2.5. Analyzátory obrazu, grafické programy, prezentační programy

3. Odborná literatura, její zdroje na internetu a PřFUK - text kapitoly v pdf, prezentace v ppt 29.10., praktická demonstrace 5.11.

3.1. Typy vědeckých sdělení a periodik
3.2. Internetové zdroje informací
3.3. Účelné vyhledávání a zpracování bibliografických záznamů a článků
   3.3.1. Bibliografické databáze přístupné na PřFUK
   3.3.2. Plnotextové databáze přístupné na PřFUK
   3.3.3. Vytváření osobních databází referencí
3.4. Scientometrie jak orientační nástroj hodnocení kvality vědecké práce

4. Informační databáze a jejich využití v experimentální biologii - text kapitoly v pdf, sekvence DNA, sekvence AMK, genevestigator file 1, file 2;  praktická demonstrace 12.11., 19.11.

4.1. Všeobecné databáze sekvencí - nástroje systémové biologie
4.2. Specializované sekvenční databáze

5. Prezentace výsledků experimentální práce - text kapitoly v pdf, prezentace v ppt 3.12., vzor plakátu v cdr a pdf, vzor prezentace v ppt, prezentace v ppt 10.12., prezentace v ppt 17.12

5.1. Bakalářská práce
5.2. Diplomová práce
5.3. Disertační práce
5.4. Vědecká sdělení na konferencích a seminářích
5.5. Vědecká publikace

Studijní texty všechny pohromadě

Zadání úkolů 1-4 k zápočtu:

Zadání úkolů 1-3, vzor vypracování úkolu 1

Zadání úkolu 4, obecné informace k vypracování úkolu 4

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Obsah kurzu z podzimního semestru 2007:

Rozšířený sylabus (obsah všech přednášek) v PDF

Základní pravidla vědecké práce - text k přednášce v PDF

Povaha a náplň vědecké práce, vědci a výzkumníci

Vědecké týmy a jejich obvyklá struktura, instituce a organizace a zákonitosti jejich fungování.

Specializace versus univerzalita moderního experimentátora – výhody a úskalí

Pozorování a experiment, co si uvědomit než vstoupíme do laboratoře, základní pravidla správné experimentální praxe, vedení protokolů a pracovního deníku, kritické využívání modelů a modelových organismů

Od informace z literatury k pozorování a experimentu, jeho kritickému zhodnocení a sepsání vlastní vědecké publikace.

Programy a postupy při zpracování experimentálních dat - text k přednášce v PDF

Programy využívané při zpracovávání obrazových a číselných dat

Tabulkové editory, statistické programy, editory grafů, grafické programy, prezentační programy

Odborná literatura, její zdroje na Internetu a PřFUK - text k přednáškám v PDF

Internetové zdroje literatury, zdroje na PřFUK, bibliografické databáze, vytváření osobních databází referencí

Typy vědeckých sdělení a jejich účel – knihy, monografie, původní články, přehledné články

Rešerše a možnosti jejich vytváření

Sympozia a kongresy - výměna informací a technologií

Informační databáze a jejich využití v experimentální biologii - text k přednášce v PDF

Databáze sekvencí – bioinformatické přístupy „in silico“

Scientometrická hodnocení a k čemu jsou dobrá

Správná vědecká praxe v širším společenském kontextu - text k přednášce v PDF
Přednášející: Prof. RNDr. Lubomír Nátr, CSc.

Etika vědecké práce, hypotéza a její ověřování, individuální a společenské důvody existence vědecké činnosti

Prezentace a publikace výsledků experimentální práce - text k přednáškám v PDF

Formální náležitosti seminární a diplomové práce

Ústní sdělení a jeho náležitosti, obhajoba diplomové práce

Vypracování ukázkového plakátového sdělení, prezentační software, způsoby tisku
Vědecká publikace, její struktura a formální náležitosti
Komunikace s editory, recenzní řízení
Vypracování ukázkové publikace

Příprava projektů a grantů – základní pravidla - text k přednášce v PDF

Grantové agentury, náležitosti grantového návrhu, životopis

-