Sylabus kurzu Praktické základy vědecké práce (B130P16)
Kurz seznamuje s praktickými základy vědecké praxe v moderní experimentální biologii. Je určen zejména studentům druhého a třetího ročníku, kteří hodlají pokračovat ve studiu experimentálních biologických oborů. Detailně budou probírána základní pravidla vědecké práce, plánování a způsoby hodnocení pokusů, zásady práce v biologické laboratoři, vedení protokolů a etická pravidla vědecké práce. Dále budou účastníci obeznámeni s účelnými postupy vyhledávání ve vědeckých databázích a nakládání s takovými údaji. Prakticky budou demonstrovány postupy přípravy vědeckého sdělení ve formě plakátu, přednášky či článku. Hlavní důraz bude kladen na praktickou demonstraci postupů využitelných při přípravě bakalářské či diplomové práce.
Zajišťuje: 130
Stav předmětu: vyučován
Rozsah v ZS: 0/2 Z (hodiny/týden)
Kredity: 2
Platnost: od 2006
Počet míst: neomezen
Vyučující: Petrášek, J.
Termín přednášky pro podzimní semestr 2010: Středa 15:40 v seminární místnosti katedry experimentální biologie rostlin PřFUK, Viničná 5, 2. patro. První přednáška se koná 6.10. V případě potřeby počítačů se přednáška bude konat v počítačové učebně B5, v úterý ve 14:00 a 16:30 a ve středu v 18:10, od 2 a 3.11. do 7. a 8. 12. 2010 (kapitoly 3. a 4.). Všechny přednášky do 27.10. se konají ve středu v 15:40 v seminární místnosti katedry experimentální biologie rostlin. Papír pro zápis do paralelek mám u sebe. Kdo se ještě nezapsal má ještě možnost, pro všechny termíny jsou ještě volná místa.
Obsah kurzu podzimního semestru 2010:
1. Základní pravidla fungování vědecké práce - 6.10. ppt, 13.10. ppt
1.1. Povaha vědecké práce
v experimentální biologii
1.2. Pozorování a pokus - základní činnosti experimentátora
1.3. Vědecké instituce a organizace, vědecké konference
1.4. Etické aspekty vědecké činnosti
1.5. Financování vědeckého výzkumu
1.6. Příprava vědeckých projektů a grantů
2. Praktické postupy zpracování experimentálních dat - 20.10. ppt
2.1. Základní organizace
práce, typy dat
2.2. Průzkumníci souborů, správné ukládání dat
2.3. Tabulkové procesory, statistické programy, editory grafů
2.4. Zpracování strukturních a sekvenčních dat
2.5. Analyzátory obrazu, grafické programy, prezentační programy
3. Odborná literatura, její zdroje na internetu a PřFUK - 27.10. ppt, praktická demonstrace 2.11 a 3.11, 9. a 10.11.
3.1. Typy vědeckých
sdělení a periodik
3.2. Internetové zdroje informací
3.3. Účelné vyhledávání a zpracování bibliografických záznamů a článků
3.3.1. Bibliografické databáze přístupné na PřFUK
3.3.2. Plnotextové databáze přístupné na PřFUK
3.3.3. Vytváření osobních databází referencí
3.4. Scientometrie jak orientační nástroj hodnocení kvality vědecké práce
4. Informační databáze a jejich využití v experimentální biologii - praktická demonstrace 23. a 24.11., 30.11. a 1.12., 7. a 8. 12, sekvence DNA, sekvence AMK, genevestigator file 1, file 2
4.1. Všeobecné databáze
sekvencí - nástroje systémové biologie
4.2. Specializované sekvenční databáze
5. Prezentace výsledků experimentální práce - 15.12. ppt, 5.1. ppt
5.1. Bakalářská práce
5.2. Diplomová práce
5.3. Disertační práce
5.4. Vědecká sdělení na konferencích a seminářích
5.5. Vědecká publikace
Zadání úkolů 1-4 k zápočtu 2010/2011:
Zadání úkolů 1-3, vzor vypracování úkolu 1
Zadání úkolu 4, obecné informace k vypracování úkolu 4
Vypracované úlohy posílejte na petrasek@ueb.cas.cz.
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Obsah minulých ročníků kurzu:
| 2007 | 2008 | 2009 |
