(English version MB130P16E)
Sylabus kurzu Praktické základy vědecké práce (B130P16)
Kurz seznamuje s praktickými základy vědecké praxe v moderní experimentální biologii. Je určen zejména studentům druhého a třetího ročníku, kteří hodlají pokračovat ve studiu experimentálních biologických oborů. Detailně budou probírána základní pravidla vědecké práce, plánování a způsoby hodnocení pokusů, zásady práce v biologické laboratoři, vedení protokolů a etická pravidla vědecké práce. Dále budou účastníci obeznámeni s účelnými postupy vyhledávání ve vědeckých databázích a nakládání s takovými údaji. Prakticky budou demonstrovány postupy přípravy vědeckého sdělení ve formě plakátu, přednášky či článku. Hlavní důraz bude kladen na praktickou demonstraci postupů využitelných při přípravě bakalářské či diplomové práce.
Zajišťován: 130
Stav: vyučován
Zimní semestr: 0/2 C (hodin/týden)
Kredity: 2
Platný: od 2006
Kapacita: neomezena
Vyučující: Petrášek, Jan
Termín přednášky pro zimní semestr 2011: Kapitoly 1 a 2 se hromadně přednášejí ve středu v 15:40 v seminární místnosti katedry experimentální biologie rostlin PřFUK, Viničná 5, 2. patro. Kapitoly 3. a 4. se konají v počítačové učebně B5, v úterý ve 14:00 a 16:30 a ve středu v 18:10, celkem tedy ve 3 paralelkách. Papír pro zápis do paralelek mám u sebe, zapíšeme to během prvních přednášek, bude prostor pro všechny. Kapitola 5 se opět přednáší hromadně ve středu v 15:40 v seminární místnosti katedry experimentální biologie rostlin PřFUK.
Obsah kurzu zimního semestru 2011:
1. Základní pravidla fungování vědecké práce - přednášky 5.10. ppt a 12.10. ppt
1.1. Povaha vědecké práce
v experimentální biologii
1.2. Pozorování a pokus - základní činnosti experimentátora
1.3. Vědecké instituce a organizace, vědecké konference
1.4. Etické aspekty vědecké činnosti
1.5. Financování vědeckého výzkumu
1.6. Příprava vědeckých projektů a grantů
2. Praktické postupy zpracování experimentálních dat - přednáška 19.10. ppt
2.1. Základní organizace
práce, typy dat
2.2. Průzkumníci souborů, správné ukládání dat
2.3. Tabulkové procesory, statistické programy, editory grafů
2.4. Zpracování strukturních a sekvenčních dat
2.5. Analyzátory obrazu, grafické programy, prezentační programy
3. Odborná literatura, její zdroje na internetu a PřFUK - přednáška 26.10. ppt, praktika 1. a 2.11 ppt, 8. a 9.11. ppt
3.1. Typy vědeckých
sdělení a periodik
3.2. Internetové zdroje informací
3.3. Účelné vyhledávání a zpracování bibliografických záznamů a článků
3.3.1. Bibliografické databáze přístupné na PřFUK
3.3.2. Plnotextové databáze přístupné na PřFUK
3.3.3. Vytváření osobních databází referencí
3.4. Scientometrie jak orientační nástroj hodnocení kvality vědecké práce
4. Informační databáze a jejich využití v experimentální biologii - praktika 15. a 16.11. ppt, 22. a 23.11, sekvence DNA, sekvence AMK, 29. a 30.11. genevestigator file 1, file 2
4.1. Všeobecné databáze
sekvencí - nástroje systémové biologie
4.2. Specializované sekvenční databáze
5. Prezentace výsledků experimentální práce - přednášky 7.12. ppt a 14.12. ppt, 21.12., vzor plakátu v cdr a pdf, vzor prezentace v ppt, vzor rukopisu původního sdělení v pdf, výsledná tištěná podoba původního sdělení v pdf
5.1. Bakalářská práce
5.2. Diplomová práce
5.3. Disertační práce
5.4. Vědecká sdělení na konferencích a seminářích
5.5. Vědecká publikace
Zadání úkolů 1-5 k zápočtu 2011/2012:
Zadání úkolů 1-4, vzor vypracování úkolu 1
Zadání úkolu 5, obecné informace k vypracování úkolu 5
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Obsah minulých ročníků kurzu:
| 2007 | 2008 | 2009 | 2010 |
