Předseda Akademie věd ČR udělil v roce 2012 tyto medaile:
Čestnou medaili AV ČR „De scientia et humanitate optime meritis“
- prof. RNDr. Blanka Říhová, DrSc. (Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.)
Čestnou oborovou medaili Bernarda Bolzana za zásluhy v matematických vědách
- prof. Gilles Godefroy (Institut de Mathématiques, Jussieu, Paris, France)
- prof. RNDr. Michal Křížek, DrSc. (Matematický ústav AV ČR, v. v. i.)
Čestnou oborovou medaili Ernsta Macha za zásluhy ve fyzikálních vědách
- prof. Allan Hugh Mac Donald, Ph.D. (The University of Texas at Austin, Texas, USA)
- prom. fyz. Milada Glogarová, CSc. (Fyzikální ústav AV ČR, v. v. i.)
- Dr. Peter Jenni (CERN, Geneva, Switzerland)
Čestnou oborovou medaili Jaroslava Heyrovského za zásluhy v chemických vědách
- prof. Ing. Miloš Marek, DrSc. (Vysoká škola chemicko-technologická)
Čestnou oborovou medaili Gregora Johanna Mendela za zásluhy v biologických vědách:
- prof. RNDr. Helena Illnerová, DrSc. (Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.)
- prof. RNDr. Václav Pačes, DrSc. (Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.)
- prof. Steven M. Reppert, MD (University of Massachusetts Medical School, Worcester, USA)
Čestnou oborovou medaili Jana Evangelisty Purkyně za zásluhy v biomedicínských vědách
- RNDr. Jaroslava Folbergrová, DrSc. (Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.)
Čestnou oborovou medaili Josefa Dobrovského za zásluhy ve filologických a filosofických vědách
- Ludmila Norajrovna Budagovová, DrSc. (Institut slavjanoveděnija, Rossijskaja akademija nauk, Moskva, Rossija)
- prof. Dr. Ulrich G. Leinsle, Dr. (Universität Regensburg, Fakultät fűr Katholische Theologie, Regensburg, Germany)
Čestnou oborovou medaili Františka Palackého za zásluhy v historických vědách
- prof. Johann P. Arnason, Ph.D. (La Trobe University, Melbourne, Australia)
Čestnou medaili Vojtěcha Náprstka za zásluhy v popularizaci vědy
- RNDr. Václav Cílek, CSc. (Geologický ústav AV ČR, v. v. i.)
- Mgr. Jan Kolář, Ph.D. (Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.)
- PhDr. Milena Secká, CSc. (Národní muzeum – Náprstkovo muzeum asijských, afrických a amerických kultur)
- Pavel Suchan (Astronomický ústav AV ČR, v. v. i.)
- doc. RNDr. František Weyda, CSc. (Biologické centrum AV ČR, v. v. i.)
Čestnou medaili Za zásluhy o Akademii věd České republiky
- Mgr. Eva Žižková, CSc. (Kancelář AV ČR)