Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 142 to 142 | ||||||||
5. Seznam uživatelů clusteru Dorje
| ||||||||
Added: | ||||||||
> > |
| |||||||
| ||||||||
Line: 151 to 153 | ||||||||
| ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | Aktualizace seznamu 4.2.2009 | |||||||
> > | Aktualizace seznamu 18.2.2009 | |||||||
Zpět |
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 53 to 53 | ||||||||
| ||||||||
Changed: | ||||||||
< < |
| |||||||
> > |
| |||||||
Zpět | ||||||||
Line: 73 to 73 | ||||||||
ssh ui.dorje.fzu.cz | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | Při prvním přihlášení se vygenerují ssh klíče, které zajišťují přenos dat mezi výpočetními uzly a login nodem. Tyto klíče nesmí uživatel změnit ani vymazat!!! | |||||||
> > | ![]() | |||||||
Zpět | ||||||||
Line: 134 to 134 | ||||||||
4.2 Typy front | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | V současné době jsou vytvořeny dvě testovací fronty: batch a test. Fronty zatím nejsou specifikovány pro určitý typ úloh. Úlohy je možné zadávat do libovolné z nich. | |||||||
> > | V současné době je pro uživatele k dispozici pouze fronta batch. | |||||||
Zpět |
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 144 to 144 | ||||||||
| ||||||||
Added: | ||||||||
> > |
| |||||||
| ||||||||
Added: | ||||||||
> > |
| |||||||
| ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | Aktualizace seznamu 20.1.2009 | |||||||
> > | Aktualizace seznamu 4.2.2009 | |||||||
Zpět |
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 9 to 9 | ||||||||
Upozornění: | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | Cluster Dorje je v testovacím režimu. | |||||||
> > | Cluster Dorje je stále v testovacím režimu. | |||||||
Obsah: | ||||||||
Line: 78 to 78 | ||||||||
Zpět | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | 3. Zadávání úloh | |||||||
> > | 3. Kompilace programu | |||||||
Changed: | ||||||||
< < | 3.1. Frontový systém Torque | |||||||
> > |
| |||||||
Changed: | ||||||||
< < | Na clusteru Dorje je nainstalován frontový systém Torque ( Terascale Open-source Resource and QUEue manager ) - opensourceová verze systému PBS. Příkazy jsou v podstate shodné s příkazy používanými v PBS. | |||||||
> > | ifort -assume buffered_io -static-intel -O3 -xHost -mtune=pentium4 -align -pad -fp-model fast=1 -ipo
4. Zadávání úloh4.1. Frontový systém TorqueNa clusteru Dorje je nainstalován frontový systém Torque ( Terascale Open-source Resource and QUEue manager ) - opensourceová verze systému PBS. Příkazy jsou v podstate shodné s příkazy používanými v PBS (např. qstat, qdel, ... ). | |||||||
Základní rozdíl je v zadávání požadavků v příkazu qsub. Parametr -l se zadává starší syntaxí nodes=...:ppn=... ( Novější syntaxe pomocí tzv. chunků select=... nefunguje). | ||||||||
Line: 91 to 132 | ||||||||
Zpět | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | 3.2 Typy front | |||||||
> > | 4.2 Typy front | |||||||
Changed: | ||||||||
< < | V současné době je vytvořena pouze jedna testovací fronta označená test. | |||||||
> > | V současné době jsou vytvořeny dvě testovací fronty: batch a test. Fronty zatím nejsou specifikovány pro určitý typ úloh. Úlohy je možné zadávat do libovolné z nich. | |||||||
Zpět | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | 4. Seznam uživatelů clusteru Dorje | |||||||
> > | 5. Seznam uživatelů clusteru Dorje | |||||||
|
Line: 1 to 1 | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Dokumentace pro uživatele SGI clusteru Dorje | |||||||||||||||
Added: | |||||||||||||||
> > | Veškeré dotazy a problémy spojené s clusterem Dorje zasílejte výhradně na e-mailovou adresu fzu zavináč rt3.cesnet.cz.
Upozornění:Cluster Dorje je v testovacím režimu. | ||||||||||||||
Obsah: | |||||||||||||||
Line: 12 to 19 | |||||||||||||||
1. Základní informace | |||||||||||||||
Added: | |||||||||||||||
> > | 1.1 Název clusteru | ||||||||||||||
dorje [:dordže:] - z tibetštiny, rituální žezlo, v překladu Diamantový klín, doslovně Pán kamene
![]() | |||||||||||||||
Changed: | |||||||||||||||
< < | 1.1 Struktura SGI clusteru Dorje | ||||||||||||||
> > | 1.2 Struktura clusteru | ||||||||||||||
1. Hardwarové vybavení | |||||||||||||||
Line: 43 to 52 | |||||||||||||||
2. Softwarové vybavení
| |||||||||||||||
Changed: | |||||||||||||||
< < |
| ||||||||||||||
> > |
| ||||||||||||||
| |||||||||||||||
Changed: | |||||||||||||||
< < | 1.2 Přihlášení uživatele | ||||||||||||||
> > | 2. Nový uživatel2.1 Zřízení uživatelského účtuÚčet bude zřízen pouze na základě žádosti schválené Pavlem Jelínkem, Pavlem Novákem nebo Františkem Mácou a zaslané na e-mailovou adresu fzu zavináč rt3.cesnet.cz. Zpět2.2 Přihlašování uživatele | ||||||||||||||
Uživatel se přihlašuje pouze na login node uživatelským jménem a heslem stejnými jako na subcluster David: ssh ui.dorje.fzu.cz | |||||||||||||||
Changed: | |||||||||||||||
< < | Při prvním přihlášení se vygenerují ssh klíče, které zajišťují přenos dat mezi výpočetními uzly a login nodem. Tyto klíče nesmí uživatel změnit !!! | ||||||||||||||
> > | Při prvním přihlášení se vygenerují ssh klíče, které zajišťují přenos dat mezi výpočetními uzly a login nodem. Tyto klíče nesmí uživatel změnit ani vymazat!!! | ||||||||||||||
Zpět | |||||||||||||||
Changed: | |||||||||||||||
< < | 1.3 Frontový systém Torque | ||||||||||||||
> > | 3. Zadávání úloh3.1. Frontový systém Torque | ||||||||||||||
Changed: | |||||||||||||||
< < | Na clusteru Dorje je nainstalován frontový systém Torque - opensourceová verze systému PBS. Příkazy jsou v podstate shodné s příkazy používanými v PBS. | ||||||||||||||
> > | Na clusteru Dorje je nainstalován frontový systém Torque ( Terascale Open-source Resource and QUEue manager ) - opensourceová verze systému PBS. Příkazy jsou v podstate shodné s příkazy používanými v PBS. | ||||||||||||||
Základní rozdíl je v zadávání požadavků v příkazu qsub. Parametr -l se zadává starší syntaxí nodes=...:ppn=... ( Novější syntaxe pomocí tzv. chunků select=... nefunguje). | |||||||||||||||
Line: 71 to 91 | |||||||||||||||
Zpět | |||||||||||||||
Changed: | |||||||||||||||
< < | 1.4 Typy front | ||||||||||||||
> > | 3.2 Typy front | ||||||||||||||
V současné době je vytvořena pouze jedna testovací fronta označená test. Zpět | |||||||||||||||
Added: | |||||||||||||||
> > | 4. Seznam uživatelů clusteru Dorje
| ||||||||||||||
-- JanaUhlirova - 04 Nov 2008 |
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 26 to 26 | ||||||||
| ||||||||
Changed: | ||||||||
< < |
| |||||||
> > |
| |||||||
Changed: | ||||||||
< < | Všechny výpočetní uzly jsou zapojeny do dvou nezávislých InfiniBand sítí. Jedna síť je určena pro přesuny dat mezi výpočetními uzly, druhá je vyhrazena pro MPI komunikaci při běhu paralelních úloh. | |||||||
> > | Všechny výpočetní uzly jsou zapojeny do dvou nezávislých InfiniBand sítí. Jedna síť je určena pro přesuny dat mezi výpočetními uzly, druhá je vyhrazena pro MPI komunikaci při běhu paralelních úloh. | |||||||
Changed: | ||||||||
< < | Jednotlivé výpočetní uzly jsou bezdiskové. Centrální datová oblast je vytvořena polem SGI IS-220 o velikosti 6TB (18 x 400GB). | |||||||
> > | Jednotlivé výpočetní uzly jsou bezdiskové. Centrální datová oblast je vytvořena polem SGI IS-220 o velikosti 6TB (18 x 400GB). | |||||||
Horní část předních dveří racku SGI | ||||||||
Line: 42 to 42 | ||||||||
2. Softwarové vybavení | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < |
| |||||||
> > |
| |||||||
| ||||||||
Changed: | ||||||||
< < |
| |||||||
> > |
| |||||||
Zpět | ||||||||
Added: | ||||||||
> > | 1.2 Přihlášení uživateleUživatel se přihlašuje pouze na login node uživatelským jménem a heslem stejnými jako na subcluster David: ssh ui.dorje.fzu.cz Při prvním přihlášení se vygenerují ssh klíče, které zajišťují přenos dat mezi výpočetními uzly a login nodem. Tyto klíče nesmí uživatel změnit !!! Zpět1.3 Frontový systém TorqueNa clusteru Dorje je nainstalován frontový systém Torque - opensourceová verze systému PBS. Příkazy jsou v podstate shodné s příkazy používanými v PBS. Základní rozdíl je v zadávání požadavků v příkazu qsub. Parametr -l se zadává starší syntaxí nodes=...:ppn=... ( Novější syntaxe pomocí tzv. chunků select=... nefunguje). qsub -q <fronta> -l nodes=...:ppn=... <skript> Zpět1.4 Typy frontV současné době je vytvořena pouze jedna testovací fronta označená test. Zpět | |||||||
-- JanaUhlirova - 04 Nov 2008 |
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 23 to 23 | ||||||||
Cluster je založen na systému SGI Altix ICE 8200. Skládá se ze 4 IRU ( Individual Rack Unit ) a několika serverů pro správu a řízení clusteru. | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < |
| |||||||
> > |
| |||||||
|
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 19 to 19 | ||||||||
1.1 Struktura SGI clusteru Dorje | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | 1. Hardwarové vybavení | |||||||
> > | 1. Hardwarové vybavení | |||||||
Cluster je založen na systému SGI Altix ICE 8200. Skládá se ze 4 IRU ( Individual Rack Unit ) a několika serverů pro správu a řízení clusteru. | ||||||||
Line: 32 to 32 | ||||||||
Jednotlivé výpočetní uzly jsou bezdiskové. Centrální datová oblast je vytvořena polem SGI IS-220 o velikosti 6TB (18 x 400GB). | ||||||||
Added: | ||||||||
> > | Horní část předních dveří racku SGI | |||||||
Changed: | ||||||||
< < | 2. Softwarové vybavení | |||||||
> > | ![]() ![]() | |||||||
| ||||||||
Line: 46 to 53 | ||||||||
| ||||||||
Added: | ||||||||
> > |
|
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 19 to 19 | ||||||||
1.1 Struktura SGI clusteru Dorje | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | 1. Hardware | |||||||
> > | 1. Hardwarové vybavení | |||||||
Cluster je založen na systému SGI Altix ICE 8200. Skládá se ze 4 IRU ( Individual Rack Unit ) a několika serverů pro správu a řízení clusteru. | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < |
| |||||||
> > |
| |||||||
| ||||||||
Line: 32 to 32 | ||||||||
Jednotlivé výpočetní uzly jsou bezdiskové. Centrální datová oblast je vytvořena polem SGI IS-220 o velikosti 6TB (18 x 400GB). | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | 2. Software | |||||||
> > | 2. Softwarové vybavení | |||||||
|
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 21 to 21 | ||||||||
1. Hardware | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | SGI cluster Dorje se skládá ze 4 IRU ( Individual Rack Unit ). Každý IRU obsahuje 16 výpočetních uzlů - bladů. Výpočetní uzly jsou dvou-procesorové, procesor typu Intel Xeon Quad-Core. Celkem je tedy v clusteru k dispozici 64 výpočetních uzlů, tj. 512 CPU. Všechny 4 IRU jsou umístěny v jednom racku o velikosti 42U. | |||||||
> > | Cluster je založen na systému SGI Altix ICE 8200. Skládá se ze 4 IRU ( Individual Rack Unit ) a několika serverů pro správu a řízení clusteru. | |||||||
Added: | ||||||||
> > |
| |||||||
Added: | ||||||||
> > | Všechny výpočetní uzly jsou zapojeny do dvou nezávislých InfiniBand sítí. Jedna síť je určena pro přesuny dat mezi výpočetními uzly, druhá je vyhrazena pro MPI komunikaci při běhu paralelních úloh. | |||||||
Changed: | ||||||||
< < | Zpět | |||||||
> > | Jednotlivé výpočetní uzly jsou bezdiskové. Centrální datová oblast je vytvořena polem SGI IS-220 o velikosti 6TB (18 x 400GB). 2. Software | |||||||
Added: | ||||||||
> > |
| |||||||
-- JanaUhlirova - 04 Nov 2008 |
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 12 to 12 | ||||||||
1. Základní informace | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | dorje [:dordže:] - z tibetštiny, rituální žezlo, v překladu Diamantový klín, doslovně Pán Kamene | |||||||
> > | dorje [:dordže:] - z tibetštiny, rituální žezlo, v překladu Diamantový klín, doslovně Pán kamene
![]() | |||||||
Deleted: | ||||||||
< < | ![]() | |||||||
1.1 Struktura SGI clusteru Dorje1. Hardware | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | Hierarchické uspořádání:
| |||||||
> > | SGI cluster Dorje se skládá ze 4 IRU ( Individual Rack Unit ). Každý IRU obsahuje 16 výpočetních uzlů - bladů. Výpočetní uzly jsou dvou-procesorové, procesor typu Intel Xeon Quad-Core. Celkem je tedy v clusteru k dispozici 64 výpočetních uzlů, tj. 512 CPU. Všechny 4 IRU jsou umístěny v jednom racku o velikosti 42U. | |||||||
Zpět |
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 14 to 14 | ||||||||
dorje [:dordže:] - z tibetštiny, rituální žezlo, v překladu Diamantový klín, doslovně Pán Kamene | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | ![]() | |||||||
> > | ![]() | |||||||
1.1 Struktura SGI clusteru Dorje | ||||||||
Line: 32 to 32 | ||||||||
-- JanaUhlirova - 04 Nov 2008 | ||||||||
Added: | ||||||||
> > |
|
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 12 to 12 | ||||||||
1. Základní informace | ||||||||
Added: | ||||||||
> > | dorje [:dordže:] - z tibetštiny, rituální žezlo, v překladu Diamantový klín, doslovně Pán Kamene
![]() | |||||||
1.1 Struktura SGI clusteru Dorje | ||||||||
Added: | ||||||||
> > | 1. Hardware
Hierarchické uspořádání:
| |||||||
Zpět -- JanaUhlirova - 04 Nov 2008 \ No newline at end of file | ||||||||
Added: | ||||||||
> > |
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
Line: 9 to 9 | ||||||||
Changed: | ||||||||
< < | Stránka se připravuje | |||||||
> > |
1. Základní informace1.1 Struktura SGI clusteru DorjeZpět | |||||||
-- JanaUhlirova - 04 Nov 2008 \ No newline at end of file |
Line: 1 to 1 | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Added: | ||||||||
> > |
Dokumentace pro uživatele SGI clusteru DorjeObsah:Stránka se připravuje -- JanaUhlirova - 04 Nov 2008 |