Časté dotazy uživatelů

Pro snažší komunikaci s uživateli byl zaveden RT (Request Tracking) system . Proto veškeré dotazy a problémy spojené s farmou Goliáš zasílejte výhradně na e-mailovou adresu fzu zavináč rt3.cesnet.cz .

1. Nový uživatel

Jak mám zažádat o zřízení účtu na farmě Goliáš?

Pokud chcete pracovat na farmě Goliáš, musíte vyplnit Žádost o zřízení účtu. Žádost podepsanou Vašim nadřízeným zašlete v papírové formě na sekretariát Sekce fyziky elementárních částic FZÚ. Pro urychlení celé procedury můžete žádost poslat faxem (fax: 286 585 443) a originál doručit do čtrnácti dnů.

Zpět

Na které stroje se můžu přihlašovat?

Přihlašujete se pouze na stroje prak2.farm.particle.cz a prak3.farm.particle.cz. V současné době si sami zvolíte, na který z praků se zalogujete.

Struktura farmy Goliáš je stručně popsána zde.

Zpět

Jak často mám měnit přístupové heslo?

Jakmile obdržíte e-mailem potvrzení o zřízení účtu, je nutné se přihlásit na prak2 a na prak3 a pomocí příkazu passwd změnit přístupové heslo. Heslo by mělo být silné, tzn. mělo by se skládat alespoň z 8 znaků a obsahovat malá a velká písmena, číslice a nealfanumerické znaky (např. %, &, *, # apod.). Heslo si můžete měnit podle vlastního uvážení.

Pozn.: Po instalaci systému LDAP bude každý nový uživatel při prvním přihlášení na kterýkoliv z praků automaticky vyzván ke změně hesla. Dokud si heslo nezmění, nebude mít možnost dále pracovat.

Zpět

2. Datové prostory

Jaké datové prostory jsou na farmě Goliáš k dispozici?

Uživatel má k dispozici domovský adresář /home a lokální pracovní adresář /scratch.

• Domovský adresář /home je vidět ze všech výpočetních uzlů. Je zálohován, jeho prostor je ale omezen kvótou.
• Lokální pracovní adresář /scratch existuje na každém výpočetním uzlu. Je vhodné ho používat pro ukládání mezivýsledků výpočtů, protože je k němu rychlejší přístup. Průběžně se promazává, není omezen kvótou. Podrobnosti zde.

Zpět

Jaké jsou v adresáři /home limity?

Rozlišujeme dva stupně limitu: soft limit a hard limit. V současné době je soft limit standardně nastaven na hodnotu 2GB, hard limit na hodnotu 2,5GB. Výhledově při překročení soft limitu obdržíte upozornění prostřednictvím e-mailu. Hard limit už překročit nemůžete. Data se přestanou zapisovat.

Zpět

Jak zjistím, kolik mám ještě v adresáři /home volného místa?

Při zalogování na prak2 se automaticky zobrazí velikost obsazeného prostoru a nastavené kvóty. Budete také upozorněn v případě, že jste už překročil soft limit.

Pozn. : Toto řešení je pouze dočasné. Výhledově bude uživatel upozorněn na překročení soft limitu e-mailem.

Míru zaplnění adresáře /home a výši limitů lze také zjistit po zalogování na prak2 nebo prak3 pomocí příkazu

ssh storage5 /usr/sbin/repquota -s /home

Podrobnější informace naleznete zde.

Zpět

Jak mohu požádat o zvýšení limitu?

Pokud potřebujete v adresáři /home větší prostor, můžete požádat o zvýšení kvóty. Svou žádost náležitě odůvodněte a pošlete prostřednictvím e-mailu Janu Švecovi nebo Tomáši Koubovi.

Zpět

Jsou soubory zálohované?

Zálohuje se pouze domovský adresář /home, a to pomocí systému Legato Net Worker. Zálohy se zapisují na pásky o velikosti 400 GB (bez komprese). Kažou noc se provádí inkrementální záloha a jednou za měsíc plná záloha. Uchovávají se 4 verze plných záloh, tj. data jsou přístupná s minimálně 3 měsíční historií.

Zpět

Jak mohu obnovit smazaný soubor?

V případě, že chcete obnovit smazaný soubor, musíte se přihlásit na prak2 nebo prak3 pomocí ssh -X a potom se už bez hesla zalogovat na storage5

ssh storage5

a zadat příkaz

nwrecover

Dostanete grafické GUI k obnově.

Podrobnější informace naleznete zde.

Zpět

3. Zadávání úloh do fronty

Do jaké fronty mám úlohy zadávat?

Základní informace o rozdělení front naleznete zde. Úlohy se nesmí posílat do front označených lcg a také do front testovacích.

Zpět

Jakým způsobem se úloha do fronty zadává?

Úloha je v zásadě skript, který si předem připravíte a potom zadáte do fronty pomocí příkazu qsub.

qsub -q <jméno fronty> <seznam parametrů> <váš skript>

• Skript se spouští ve vašem domovském adresáři. Proto je třeba u všech příkazů, které nejsou v domovském adresáři, použít plnou cestu nebo příkaz cd.
• Při spuštění úlohy se v pracovním adresáři /scratch automaticky vytvoří podadresář /pbstmp.cislojobu.golias. Současně se vytvoří proměnná $TMPDIR, která do tohoto adresáře ukazuje. Proto je třeba ve skriptu pro uložení dočasných dat použít proměnnou $TMPDIR. Podadresář se po skončení úlohy automaticky smaže.

Podrobné informace o příkazu qsub naleznete zde.

Zpět

- JanaUhlirova - 01 Jul 2008