Kamenik ukazal svoje pokusy s fuzema - dohodli jsme se, ze je potreba dat vedle sebe k vizualnimu porovnani model, ktery asi pouziva Belohlavek, a nejaky novy, ktery by jasne fungoval lip. Mozna v pondeli...
Odpoved doc. Belohlavka:
Ke Gaussovskému filtru nás SW trochu nutí, dost možná ale můžeme použít i jiný typ předdefinovaného filtru. Kernel 7 mm používáme proto, že už dost dobře potlačuje šum, ale přitom ještě příliš nedegraduje fyzikální prostorové rozlišení skeneru, které se pohybuje také někde kolem 7 mm. Hodnotu kernelu můžeme libovolně měnit - tedy třeba i 4 mm, což má smysl u fantomových měření, tj. tam, kde mám nízký šum a rekonstruuji do jemnější matice, tzn, abych filtrem nedegradoval fyzikální rozlišení skeneru. All pass filter je předpokládám "nefiltr", který pustí všechny frekvence - čili jiný filtr než Gaussovský (ale bůhví, zda-li si to představují správně).
Interpretaci počtu iterací a subsetů pro PET sinogram raw dat bohužel neumím. Jsem si ale skoro jist, že zde subset neznamená 8 řezů. Řekl bych, že se spíše jedná o nějaké číslo vyjadřující míru seskupení sobě podobných koincidenčních přímek, které pak společně vstupují do iterace.
Muj komentar:
Gaussovky jsou jasne. K tem iteracim a subsetum - docetl jsem se, ze se dnes hodne pouziva rekonstrukcni metoda OS-EM a uvedene pojmy koresponduji s pojmy te metody. Prakticky se o to nemusime starat.
K tomu mam ale poznamku, ze me osobne by zajimalo o te metode neco vedet. Pokud by to nekoho zajimalo a mel na to cas, bylo by super neco slyset o metode a prislusnem softwaru, jestli je k dispozici. Jinak ja se k tomu casem asi dopracuju taky. Motivaci je zatim jen vseobecny prehled, nicmene myslel bych si, ze nekde pujde ten OSEM stahnout a pak bychom si mohli mozna rekonstruovat Belohlavkova raw data, kdybychom tomu rozumeli. :-)
Ja jsem slibil, ze do pondeli vyrobim z dicomu nejake 3D tify nebo 3D dicomy, aby se na tom dalo hned neco zkouset.
Pro C# priznivce - Kamenik nas upozornil na managed ITK.
Filipe, dej prosim vcas vedet, kdy budem moct vyzkouset GATE, at se na to znova podivam.
