ODDĚLENÍ ÚSTAVU
Ústav fotoniky a elektroniky je členěn na tato výzkumná oddělení:

Oddělení číslicového zpracování signálu a syntézy řeči
Vedoucí: Ing. Petr Horák, Ph.D.
Oddělení času a frekvence
Vedoucí: Ing. Alexander Kuna
Oddělení vlnovodné fotoniky
Vedoucí: Ing. Jiří Kaňka, CSc.
Oddělení optických senzorů
Vedoucí: Doc. Ing. Jiří Homola, CSc., DSc.
Oddělení technologie optických vláken
Vedoucí: Dr. Ing. Ivan Kašík
Oddělení technologie
Vedoucí: RNDr. Olga Procházková, CSc.
Oddělení diagnostiky
Vedoucí: RNDr. Vladimír Kuzmiak, CSc.
Ostatní oddělení:

Sekretariát
Vedoucí: Ing. Vlastimil Matějec, CSc.
Ústavní středisko vědeckých informací
Vedoucí: Mgr. Petr Vacek
Oddělení informačních technologií
Vedoucí: Mgr. Jan Jirmásek
Mechanická dílna
Vedoucí: Karel Svoboda
Oddělení ekonomicko-správní
Vedoucí: Ing. Jana Škořepová
Oddělení služeb a zásobování
Vedoucí: Věra Šilhavá