04-GAJU-43
Cieľom projektu je zistenie populačnej diverzity na základe stanovenia intra- a intergenomovej variability ITS sekvencií jednotlivých izolátov druhu Chloromyxum cyprini, ktorý je bežným parazitom kaprovitých rýb v Českej republike. Pre určenie sekvenčnej variability budú konkrétne sekvenované úseky 5,8S a priľahlé úseky (ITS1 a ITS2). Následné fylogenetické analýzy môžu odhaliť prípadnú existenciu genotypov, hostiteľskú špecifitu a závislosť na geografii medzi jednotlivými izolátmi. Naše výsledky môžu poukázať na potenciálne využitie rDNA medzerníkov pre posúdenie fylogenetických vzťahov v rámci taxónov skupiny Myxosporea. Pre podporu predchádzajúcich výsledkov budú použité aj viaceré taxóny a proteín-kódujúci gén (mt COI).
