Třetí křížová výprava dle kronikáře Ansberta: Historie o výpravě císaře Fridricha, z latiny přeložil a historickým úvodem opatřil Pavel Soukup, Příbram 2003, 153 s.

Články a studie

Dvojí ideál křesťanského rytíře v husitském období, Český časopis historický 99, 2001, s. 1–32

Rytíři a kacíři. Alegorie zápasů víry a svatojiřská legenda v Jindřichově Hradci, Kuděj 3, 2001, s. 14–32

Władza prawowita i wojna sprawiedliwa w myśli husyckiej, in: Monarchia w średniowieczu. Władza nad ludźmi, władza nad terytorium, ed. Jerzy Pysiak, Aneta Pieniądz-Skrzypczak a Marcin Rafał Pauk, Warszawa – Kraków 2002, s. 335–350

Dobývání hradu Skály v roce 1413 a husitská teorie války. Ke spisku Jakoubka ze Stříbra o duchovním boji, Mediaevalia Historica Bohemica 9, 2003, s. 175–210

Lucemburské období v pojetí historiků „Spolku pro dějiny Němců v Čechách“ do roku 1900, in: Ad vitam et honorem. Profesoru Jaroslavu Mezníkovi přátelé a žáci k pětasedmdesátým narozeninám, ed. Tomáš Borovský, Libor Jan a Martin Wihoda, Brno 2003, s. 167–175

Rytíři ducha na pražské univerzitě. Jakoubkovo kázání Abiciamus opera tenebrarum, in: Evropa a Čechy na konci středověku. Sborník příspěvků věnovaných Františku Šmahelovi, ed. Eva Doležalová, Robert Novotný a Pavel Soukup, Praha 2004, s. 413–431

Johann Loserth a český středověk, in: Německá medievistika v českých zemích do roku 1945, ed. Pavel Soukup a František Šmahel (= Práce z dějin vědy 18), Praha 2004, s. 251–272

Počátky vědecké dráhy Johanna Losertha a pražská univerzita, Acta Universitatis Carolinae – Historia Universitatis Carolinae Pragensis 44, 2004, s. 19–44

Exotika v kodexu opata Jarlocha. Historie o křížové výpravě císaře Fridricha I., Dějiny a současnost 26, 2004, č. 4, s. 36–39

Čech, nebo Němec? Spor o národní příslušnost Karla IV., Dějiny a současnost 27, 2005, č. 1, s. 38–40

Die Waldenser in Böhmen und Mähren im 14. Jahrhundert, in: Friedrich Reiser und die „waldensisch-hussitische Internationale“, hg. Albert de Lange und Kathrin Utz Tremp (= Waldenserstudien 3), Heidelberg – Ubstadt-Weiher – Basel 2006, s. 131–160

K počátkům Jakoubkovy literární činnosti: nejstarší univerzitní kázání, in: Jakoubek ze Stříbra. Texty a jejich působení, ed. Ota Halama a Pavel Soukup, Praha 2006, s. 121–152

Karel IV. jako obránce víry. Souvislosti neuskutečněného španělského tažení z roku 1340, in: Ve znamení zemí Koruny české. Sborník k šedesátým narozeninám prof. PhDr. Lenky Bobkové, CSc., ed. Luděk Březina, Jana Konvičná a Jan Zdichynec, Praha 2006, s. 198–209

Pilgrimage element in crusades with Czech participation in the twelfth century, in: Wallfahrten in der europäischen Kultur. Pilgrimage in European Culture, hg. Daniel Doležal und Hartmut Kühne (= Europäische Wallfahrtsstudien 1), Frankfurt am Main 2006, s. 53–64

„Sed heu hodie!“ Kritika církve v Jakoubkových kázáních k duchovenstvu, in: Od knížat ke králům. Sborník u příležitosti 60. narozenin Josefa Žemličky, ed. Eva Doležalová a Robert Šimůnek ve spolupráci s Danou Dvořáčkovou a Alešem Pořízkou, Praha 2007, s. 438–453

Svatá válka v představách husitských mistrů. K formování a zdrojům husitského učení o válce, in: Jan Žižka z Trocnova a husitské vojenství v evropských dějinách, ed. Miloš Drda a Zdeněk Vybíral (= Husitský Tábor, Supplementum 3), Tábor 2007, s. 277–289

Mezi klášterem a válkou? Křížové výpravy a vznik rytířských řádů, Dějiny a současnost 29, 2007, č. 1, s. 30–33

Metaphors of the Spiritual Struggle Early in the Bohemian Reformation: The Exegesis of Arma Spiritualia in Hus, Jakoubek, and Chelčický, in: The Bohemian Reformation and Religious Practice, vol. 6, ed. Zdeněk V. David, David R. Holeton, Prague 2007, s. 87–109

Johann Loserth (1846–1936). Ein „Gelehrter von Weltruf“ in Czernowitz und Graz, in: Österreichische Historiker 1900-1945. Lebensläufe und Karrieren in Österreich, Deutschland und der Tschechoslowakei in wissenschaftsgeschichtlichen Porträts. Hg. von Karel Hruza, Wien – Köln – Weimar 2008, s. 39-71

„Ne verbum Dei in nobis suffocetur…“ Kommunikationstechniken von Predigern des frühen Hussitismus, Bohemia 48, 2008, s. 54-82

Editor

Tschechische Mittelalterforschung 1990–2002, hg. František Šmahel, Robert Novotný und Pavel Soukup. Praha 2003, 224 s.

Evropa a Čechy na konci středověku. Sborník příspěvků věnovaných Františku Šmahelovi, ed. Eva Doležalová, Robert Novotný a Pavel Soukup, Praha 2004, 470 s.

Německá medievistika v českých zemích do roku 1945, ed. Pavel Soukup a František Šmahel (= Práce z dějin vědy 18), Praha 2004, 396 s.

Jakoubek ze Stříbra. Texty a jejich působení, ed. Ota Halama a Pavel Soukup, Praha 2006, 276 s.