13. června 2008 -  Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i. získal pro svůj výzkum v oblasti genové exprese unikátní vysokokapacitní zařízení BIOMARK (výrobce Fluidigm, http://www.fluidigm.com/), umožňující provedení paralelní expresní analýzy 48-96 genů v rámci jediného experimentu (2,304 qPCR reakcí na jediném čipu).

Vysoká kapacita tohoto zařízení umožňuje sledování exprese řady genů v jediné buňce, významně urychlí objasňování regulačních mechanismů buňky, mechanismů její odpovědi na nejrůznější stimuly jako jsou např. enviromentální vlivy, farmaka či mechanismů diferenciace (reference).

Přístroj BIOMARK je umístěn v Laboratoři genové exprese, jejímž vedoucím je Prof. M. Kubišta.

V rámci této laboratoře bylo vytvořeno otevřené servisní qPCR pracoviště pro analýzu genové exprese, které bylo zpřístupněno vědecké komunitě počátkem roku 2009.

Toto servisní pracoviště nabízí:

• Navržení a zpracování postupu pro Váš qPCR experiment
• RNA/DNA izolace pomocí QIAcube automatického izolačního přístroje (Qiagen)
• Navržení primerů/ prób
• Kontrola kvality nukleových kyselin pomocí Nanodropu včetně  Nanodrop Ribogreen determinace pro málo koncentrované vzorky pomocí Nanodrop fluorospectrometru
• Kontrola kvantity nukleových kyselin  pomocí  bioanalyzačního přístroje Experion (Bio-Rad)
• Reverzní transkripce
• Preamplifikace
• Provedení qPCR experimentu: destička 96 reakcí s pomocí 3 různých termocyklérů (Realplex Mastercycler Eppendorf, C1000 Bio-Rad, Rotor Gene 6000 Qiagen)
• Provedení  qPCR Biomark experimentů: Dynamic gene expression array (48x48 reakcí), Digital array(http://www.fluidigm.com/)
• High resolution melt (Rotor Gene 6000 Qiagen)
• Analýza dat
• Poskytování široké škály qPCR kurzů poskytované pod záštitou švédsko-česko-německé společnosti TATAA (http://www.tataa.com/)

Podrobnější informace o poskytovaných službách a cenách najdete na webové stránce Laboratoře genové exprese nebo na adrese servisního pracoviště pod vedením Vlasty Čtrnácté, PhD. (qPCR core@img.cas.cz).