Personal tools
You are here: Home Projects Traps Jitka Mily denicku 071102
Document Actions

071102

linux prikazy, typy tabulek v MySQL, prikazy pro program siRNA

Prikazy pro linux:

  • ctrl+0 = schova mi mc
  • nano jmeno doc= upravuji uz dany dokument
  • \ =escape charakter = meni se vyznam znaku za nim
  • ^ = ctrl
  • M = alt

Prikazy pro mysql:
  • create table test1;
  • drop table test1; = vymazat tabulku test1
  • existuji 2 typy tabulek: INNODB, ktera ma constrains a MyISAM, ktera je nema
  • set foreign_key_checks=0; = vypnu constrains u tabulky INNODB
  • set foreign_key_checks=1; = zapnu constrains tabulky INNODB
  • pozn.constrains= omezeni, napr. jedna tabulka potrebuje jinou pro spravne vlozeni dat
  • alter table test1 engine = MyISAM; = test1 tabulka byla predtim v INNODB typu a ted jsem ji zmenila na MyISAM = budou se ignorovat constrains, jelikoz typ MyISAM je nema

Bioknoppix:
na windows disku si udelam soubor, na ktery budu ukladat data z linuxu
  • startx = otevre se mi graficke rozhrani
  • reboot  nebo shut down = vypnu nahrany linux, CD pak vyjmu, spustim enter a nabehnou mi Windows

siRNA:
  • cd sirna
  • cd .. = pujdu o uroven vys
  • mkdir s2 = vytvorim si v Traps novou slozku s2
  • cd s2
  • ../sirna/sirna_alignment.pl ../sirna/trap.fa ../sirna/sirna_trap.tab test2 = program a data jsou vzaty ze sirny, ale vysledek se mi ulozi do s2 directory




Powered by Plone CMS, the Open Source Content Management System

This site conforms to the following standards: