Výzkumný zájem Marcely Linkové se soustřeďuje na zkoumání postavení žen ve vědě, konstrukci vědeckých institucí a vědění z genderového hlediska a na feministické epistemologie. Dále se zabývá problematikou násilí na ženách z genderové perspektivy.
řešitelka projektů:
2006-2008 Knowing, Institutions, Gender: an East-West Comparative Study, Evropská komise, 6. Rámcový projekt
2005-2008 Národní kontaktní centrum - ženy a věda, Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy, program EUPRO
2004-2007 Central European Centre for Women and Youth in Science, Evropská komise, 6. Rámcový projekt
- předsedkyně Pracovní skupiny pro otázku postavení žen ve vědě zřízenou MŠMT
- Rada pro podporu účasti AV ČR na evropské integraci výzkumu a vývoje
- Expert Advisory Board Science in Society, Evropská komise
