Analýza genových regulačních sítí řídících indukci kvetení u krátkodenních merlíků Chenopodium rubrum a C. quinoa

Typ: 
Doktorská práce

     Principy regulace kvetení byly podrobně objasněny u dlouhodenního modelu Arabidopsis thaliana. Pokusy s krátkodenními druhy (rýže, Pharbitis nil) ukázaly jak shodu ve využití genů ortologních s Arabidopsis thaliana, tak rozdíly ve funkci u některých klíčových genů. V naší laboratoři využíváme tradiční modelové krátkodenní rostliny merlíku červeného (Chenopodium rubrum). Nalezli jsme u nej ortholog genu FT (FLOWERING LOCUS T) a dva homology genu CONSTANS like (COL), u kterých jsme prokázali alternativní splicing. Expresní profily studovaných genů za induktivních a neinduktivních podmínek odpovídaly situaci u jiných krátkodenních rostlin. Nalezli jsme však i významne rozdíly poukazující na jedinečnost regulačních vztahů u merlíku. V rámci pokračování tohoto projektu budeme analyzovat homologa dalších COL genů a pokusíme se nalézt i další klíčové hráče v regulaci kvetení u merlíku. C. quinoa je merlík sloužící jako důležitá plodina v Andách. Objasnění indukce kvetení u C. quinoa umožní v budoucnu genové modifikace této nadějné, na sucho i zasolení odolné plodiny. Všechny potřebné molekulární metody jsou v laboratoři zavedeny.
 
Pracoviště: Ústav experimentální botaniky AV ČR, Praha 6, Lysolaje

Kontakt: 
Helena Štorchová