Alica Chroňáková

Mgr.

E-mail: alicach@upb.cas.cz

Tel: ++420-38-7775766

Fax: ++420-38-5300133

Funkce, pracovní zařazení:

PhD. student, Biologická fakulta Jihočeské Univerzity, katedra ekologie a hydrobiologie, Branišovská 31 , Č. Budějovice

výzkumný pracovník, oddělení půdní mikrobiologie a chemie, Ústav půdní biologie AV ČR, Na Sádkách 7, Č. Budějovice

Vzdělání, kvalifikace

1990-95 Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova v Praze, obor molekulární biologie a mikrobiologie, rok získání titulu mgr.: 1995

1995-01 mateřská dovolená

2000 Nemocnice Písek, odd. hematologie a krevní transfuze, VŠ pracovník, kontrola kvality

2000 - 2002 OSVČ, zároveň Plaváček s.r.o., učitelka plavání

2002 - ÚPB AV ČR, Č. Budějovice, pomocný vědecký pracovník

2003 - BF  JČU v Českých Budějovicích, začátek postgraduálního studia

Vědeckovýzkumná činnost:   

Ekologie půdních aktinomycet, genetická diverzita (16S rDNA) mikrobiálních společenstev, primární sukcese, hnědouhelné výsypky, archebakterie, aktivita půdních mikrobiálních společenstev na úrovni DNA, mRNA – geny pro denitrifikaci, metanogenezi. 

Vědecké projekty (v posledních 5 letech):

Diverzita půdních aktinomycet v průběhu primární sukcese na hnědouhelných výsypkách, Grantová agentura JU v Č. Budějovicích (54/2004/P-BF), 2005, hlavní řešitel

Projekt navazuje na řešení problematiky studia diverzity mikrobiálního společenstva v procesu primární sukcese na hnědouhelných výsypkách (GAČR 526/03/1259, řešitel RNDr. D. Elhottová, PhD.). Studium je zaměřeno na kultivovatelnou část aktinomycetového společenstva a má dva cíle:

1)                      Stanovit změny ve složení aktinomycetového společenstva v průběhu primární sukcese na různě starých hnědouhelných výsypkách a stanovit vývoj dominantních druhů aktinomycet a to v závislosti na distribuci dominantních ribotypů aktinomycetů (16S rDNA patternů) v daném společenstvu pomocí metody ARDRA.

2)                      Analyzovat dominantní heterotrofní aktinomycety pomocí TGGE a stanovit podmínky pro analýzu aktinomycetového společenstva získaného amplifikací 16S rDNA z DNA extrahované ze substrátů na hnědouhelných výsypkách.

Analýzou kmenů aktinomycet se zjistilo, že diverzita a bohatost kultivovatelné části populace roste v primární sukcesi až do raného a středního stadia (11 – 21 let stará výsypka) v závislosti na vrstvě odběru.  Byly vybrány typové kmeny reprezentující dané společenstvo, pro které byly zjištěny parciální sekvence 16S rDNA  a bude vytvořena fylogenetická analýza.

Publikace:

Celkem 13 vědeckých a odborných prací (z toho 2 původní vědecké práce v časopisech s IF, 1 revidován) a 9  abstraktů příspěvků na konferencích.

10 vybraných publikací z poslední doby:

Elhottová, D., Krištůfek, V., Frouz, J., Nováková, A., Chroňáková, A., 2005. Screening for microbial markers in Miocene sediment exposed during open-cast brown coal mining. Antoine van Leeuvenhoek (accepted).

Krištůfek, V., Elhottová, D., Chroňáková A., Dostálková, I., Picek, T., Kalčík, J., 2005. Growth Strategy of Heterotrophic Bacterial Population Along Successional Sequence on Spoil of Brown Coal Colliery Substrate. Folia Microbiologica (accepted).

Chroňáková, A., Krištůfek, V., Elhottová, D., Tichý, M.: Structural changes of actinomycete communities along primary succession process on non-reclaimed post-mining sites. BAGECO8, Book of abstracts, Lyon, France, June 26-29, 2005, p.94.

Elhottová, D., Krištůfek, V., Frouz, J., Chroňáková, A., Nováková, A., Lukešová, A.: Microbial biomarkers and fossils in tertiery cypris clay sediment uncovered during brown coal mining. Integrated Soil and Sediment Assessment. Brno, February 10-12, 2005.

Malý, S., Elhottová, D., Frouz, J., Chroňáková, A.,  Krištůfek, V., Kalčík, J., Picek T.  2005. Functional and Structural Diversity of Soil Microbial Communities on Colliery Spoils Heaps. The World Conference on Ecological Restoration, Book of abstracts, Zaragoza, Spain, September 12-18, 2005, p. 219.

Chroňáková, A., Krištůfek, V., Elhottová, D., Malý, S.(Eds.): Present methods for investigation of microbial community biodiversity in soils and substrates. Institute of Soil Biology AS CR, České Budějovice, ISBN 80-86525-03-1, 2004.

Chroňáková, A., Elhottová, D., Malý, S., Krištůfek, V., 2004. Approaches applied in study of soil microbial diversity in brown coal post-mining chronosequences. Phytopedon 3:35-39.

Chroňáková, A., Halbritter, A., Krištůfek, V., Biró, B., 2004. Analysis of bacterial isolates and community DNA from four different succession plots in post-mining area, pp. 93-97 in A. Chroňáková, V. Krištůfek, D. Elhottová, S. Malý (Eds.): Present methods for investigation of microbial community biodiversity in soils and substrates. Institute of Soil Biology AS CR, České Budějovice, ISBN 80-86525-03-1, 2004.

pro úplný seznam publikací klikněte sem