Untitled Page
Dana Elhottová
RNDr., Dr. (PhD.)
E-mail: danael@upb.cas.cz
Telefon: ++420-385 310 174; ++420-387 775 766
Fax: ++420-385 310 133
Funkce, pracovní zařazení:
samostatný vědecký pracovník
místopředseda Vědeké rady ÚPB AV ČR
Vzdělání, kvalifikace
1984-1989 Přírodovědecká fakulta, Univerzita Karlova, Praha, obor všeobecná biologie, specializace mikrobiologie, rok získání titulu RNDr.: 1989
1994-1998 Biologická fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích a ÚPB AV ČR, doktorské studium v oboru ekologie mikroorganizmů, rok získání titulu Dr. (PhD): 1998
od r. 1999 vědecký pracovník ÚPB AV ČR
od r. 2003 samostatný vědecký pracovník
Vědeckovýzkumná činnost:
Studium mikrobiálních společenstev in situ, zejména s pomocí technik lipidických biomarkerů.
(studium struktury, skladby, diverzity, růstového a výživového statusu, životních strategií společenstev mikroorganismů v půdách, rhizosféře, hlubinných sedimentech, jeskynních sedimentech a zažívacích traktech půdních bezobratlých)
Studium půdních heterotrofních mikroorganismů na úrovni čistých kultur.
(druhová identifikace, fyziologie, ekologie, produkce biologicky aktivních látek, stresových indikátorů)
Studium role aktivních (i fosilních) půdních mikrobiálních společenstev v procesu primární sukcese, sekundární sukcese, půdním potravním řetězci.
Vědecké projekty (v posledních 5 letech):
Charakterizace půdního mikrobiálního společenstva analýzou lipidických biomarkerů (GA ČR, 1999-2001, řešitelka)
V rámci postdoktorského projektu byla rozpracována a v rámci ČR zavedena metodika pro komplexní popis půdních mikrobiálních společenstev formou analýzy mikrobiálních lipidů a jejich složek. Přístupy založené na kvalitativních a kvantitativních analýzách mastných kyselin membránových a zásobních lipidů mikroorganizmů dovolují hodnotit přirozená společenstva in-situ nezávisle na izolaci a kultivaci mikrobů, ale i chemotaxonomickou identifikaci mikrobiálních izolátů: (i) Analýza profilů fosfolipidických mastných kyselin (PLFA fingerprint) umožňuje kvalitativní hodnocení kompletního společenstva půdních mikroorganizů, odhad jeho aktivní biomasy, bohatosti a diverzity. Pomocí analýzy mnohonásobného porovnání lze na základě PLFA profilů rozlišit kvalitativně rozdílná společenstva a určit vlivy prostředí zodpovědné za tyto rozdíly. (ii) Taxonomické PLFA-biomarkery, lze použít k detekci, odhadu biomasy a zastoupení hlavních taxonomických skupin půdního mikrobiálního společenstva. (iii) Stres-indikující PLFA-biomarkery jsou vhodné pro indikaci nepříznivých podmínek prostředí. (iv) Analýza mastných kyselin obsažených v zásobních lipidech slouží k charakterizaci růstového a výživového statusu mikrobiálního společenstva. (v) Druhovou identifikaci čistých kultur heterotrofních bakterií, aktinomycétů, kvasinek a mikromycétů umožňuje aplikace systému MIS Sherlock, založeného na analýze profilu celulárních mastných kyselin. (vi) Detekce fyziologicky významných polynenasycených mastných kyselin (PUFA) produkovaných mikroorganizmy slouží k vyhledávání biotechnologicky významných mikroorganizmů.
Diverzita a struktura půdního mikrobiálního společenstva během primární sukcese na hnědouhelných výsypkách: DNA-, PLFA-, Biolog System- analýzy (GA ČR, 2003-2005, řešitelka)
Oblasti s ukončenou těžební činností představují ve střední Evropě jednu z mála příležitostí pro výzkum spontánní sukcese půdních společenstev v procesu pedogeneze. Hlavním cílem projektu je popis diverzity komplexního půdního mikrobiálního společenstva v procesu primární sukcese. Výzkum je realizován na hnědouhelných výsypkách (Sokolovská hnědouhelná a.s.) ponechaných samovolné sukcesi různou dobu (0, 10, 20 a 40 let po navršení výsypkového substrátu). Metodologie založená na aplikaci a kombinaci současných technik environmentální mikrobiologie (analýza DNA, analýza lipidických biomarkerů a analýza utilizace uhlíkatých substrátů) dovoluje odlišné kvalitativní hodnocení mikrobiálního společenstva. Dosažené výsledky potvrzují v souladu se sukcesní teorií postupné zvyšování strukturní i funkční diverzity komplexního mikrobiálního společenstva. Zároveň indikují specifické sukcesní mechanismy zejména na úrovni prokaryotické části společenstva a osvětlují hlavní faktory prostředí zodpovědné za kvalitativní změny mikrobiálního společenstva v procesu pedogeneze. Projekt přináší originální výsledky v oblasti environmentální mikrobiologie, půdní biologie a ekologie. Získané teoretické poznatky mohou být přínosem pro formování strategií a zlepšování rekultivačních technologií při obnově území zničených různými katastrofami.
Mikrobiální diverzita pastevních půd ve vztahu k vlivu pasených zvířat (česko-německý projekt DAAD & AV ČR, 2005-2006, řešitelka)
Studium vazby mezi diverzitou půdních mikrobiálních společenstev a emisemi skleníkových plynů z pastevní půdy zatížené paseným skotem je předmětem společného projektu Ústavu půdní biologie AV ČR a německého Ústavu půdní ekologie-GSF v Neuherbergu. Strukturní a funkční diverzita společenstva je studována pomocí analýzy lipidických biomarkerů, genomických a proteomických metod. Zvláštní pozornost je věnována skupině Archaea a jejímu podílu na emisích skleníkových plynů.
Studium trofických vazeb mezi půdními bezobratlými a mikroflórou jeskyní Národního parku Slovenský kras (AV ČR & Slovenská akademie věd, 2003-2005, řešitelka)
Úloha mikroflóry v potravních interakcích s půdními bezobratlými je studována v jeskyních Slovenského krasu na různých úrovních. Komplexní charakteristika mikrobiálních společenstev jeskynních sedimentů a jejich porovnání s půdními společenstvy je prováděna technikami lipidických biomarkerů a pomocí růstové charakteristiky kultivovatelné a komplexní složky společenstva . Druhové zastoupení představitelů bakteriální, houbové a řasové složky společenstva je studováno různými kultivačními, mikroskopickými a biochemickými technikami. Identifikované mikrobiální izoláty jsou aplikovány v potravně preferenčních testech jako potravní zdroj jeskynního živočicha Mesoniscus graniger (Frivaldsky, 1865) (Crustacea: Isopoda). Vyhledávání zdrojů fyziologicky významných polynenasycených mastných kyselin, esenciálních pro živočichy, je prováděno zejména na úrovni jeskynních microorganizmů.
Hodnocení kvality půd na základě monitoringu chemických a mikrobiologických vlastností (AS CR & Maďarská akademie věd, 2004-2006, řešitelka)
Hlavním cílem projektu je zlepšení a vývoj metod vhodných pro monitoring kvalitativních vlastností půdy s důrazem na uplatňování molekulárních technik pro strukturní a funkční charakterizaci mikrobiální složky půdy.
Publikace:
Celkem 82 vědeckých a odborných prací a sdělení (z toho 14 původních vědeckých prací v časopisech s IF).
10 vybraných publikací:
Elhottová, D., Tříska, J., Šantrůčková, H., Květoň, J. Šantrůček, J. and Šimková, M., 1997. Rhizosphere microflora of winter wheat plants cultivated under elevated CO2. Plant and Soil 197, 251-259.
Elhottová, D., Tříska, J., Petersen, S. O., and Šantrůčková, H., 2000. Analysis poly-b-hydroxybutyrate (PHB) in environmental samples by GC-MS/MS. Fresenius´Journal of Analytical Chemistry, 367, 157-164.
Oravecz, O., Elhottová, D., Krištůfek, V., Šustr, V., Frouz, J., Tříska, J., Márialigeti, K., 2004. Application of ARDRA and PLFA analysis in characterizing the bacterial communities of the food, gut and excrements of saprophagous larvae of Penthetria holosericea (Diptera: Bibionidae): a pilot study. Folia Microbiologica 49, 83-93.
H. Šantrůčková, M.I. Bird, Y.N. Kalaschnikov, M. Grund, D. Elhottová, M. Šimek, S. Grigoryev, G. Gleixner, A. Arneth, E.D. Schulze, J. Lloyd (2003): Microbial characteristics of soils on a latitudinal transect in Siberia. Global Change Biology 9: 1106-1117
Uhlířová, E., Elhottová, D., Tříska, J., Šantrůčková, H., 2005. Physiology and Microbial Community Structure in Soil Extreme Water Content. Folia Microbiologica 50 (2), 161-166.
Šimek M., Elhottová D., Klimeš F., Hopkins D.W., 2004. Emission of N2O and CO2, denitrification measurements and soil properties in red clover and ryegrass stands. Soil Biology and Biochemistry 36, 9-21.
Elhottová, D., Szili-Kovács, T., Tříska, J. (2002) Microbial Communities of Abandoned Fields. Folia Microbiologica 47 (4), 435-440.
Šantrůčková, H., Bird, M.I., Elhottová, D., Novák., J., Picek., T., Šimek, M., Tykva, R., 2005. Heterotrophic Fixation of CO2 in Soil. Microbial Ecology 49, 218-225.
Elhottová, D., 2004: Fatty Acids Patterns in Characterization of Soil Microbial Community in Process of Primary Succession on Post-mining Sites. In: Chroňáková, A., Krištůfek, V., Elhottová, D., Malý, S. (Eds.): Present method for investigation of microbial community biodiversity in soils and substrates. Proc. 9th Methodological workshop, ISB AS CR, České Budějovice, pp. 17-21.
Elhottová, D., Krištůfek, V., Nováková, A., Lukešová, A., Tříska, J., Kováč, L., Mock, A., Luptáčik, P., 2004. Sources of polyunsaturated fatty acids in caves of Slovak Karst. In: Bella, P. (Ed.), Investigation, Exploatation and Preservation of Caves, 4th Scientific Conference with International Participation. Liptovský Mikuláš, pp. 155-161. [In Czech with English abstract]
(pro úplný seznam publikací klikněte sem)
|
O ústavu