PRACOVNÍ SKUPINA STRUKTURNÍ ANALÝZY MOLEKUL

English text at old web: http://www.imc.cas.cz/en/imc/struanal/molstru/

Výzkum Vybrané publikace

Pracovní skupina pro strukturní analýzu molekulb

Vedoucí: RNDr. Jindřich Hašek, DrSc. (tel. 296 809 205, e-mail: hasek@imc.cas.cz)

Výzkum

Metoda

  • Proteinová krystalografie. Rentgenová strukturní analýza  makromolekul. Purifikace, krystalizace, měření a vyřešení atomární 3D struktury molekul.
  • Doplňkové metody: výzkum makromolekul v roztoku. Vývoj krystalizačních screenů. Počítačové simulace - molekulární dynamika. Systematika a vývoj databází.

 

Výzkumné projekty

Zabýváme se převážně vztahem struktury a funkce proteinů a jejich komplexů s ligandy, ale i jiných uspořádaných makromolekul schopných krystalizace. Proteiny pro strukturní výzkum jsou většinou připraveny ve spolupracujících laboratořích.

  • Extracelulární domény receptorů zabíječský‎ch buněk imunitního systému (spolupráce s MBÚ AV ČR, v.v.i. a PřF UK)
  • Průmyslově využitelné oxidoreduktázy (spolupráce: firma Novozymes)
  • Doposud strukturně necharakterizované enzymy (dvoudoménová lakáza)
  • Proteiny operující na DNA/RNA
  • Systematické strukturní studie imunoglobulinů
  • Chitinolytick‎ý komplex enzymů bakterií střevní mikroflory (spolupráce UŽFG AV ČR, v.v.i.)
  • Chladově aktivní beta-galaktosidáza (spolupráce: VŠCHT Praha)
  • HIV-1 proteáza a její interakce s inhibitory, vliv mutací (spolupráce: ÚOCHB AV ČR)
  • Interakce protein - polymer (spolupráce: evropské laboratoře)

Vybavení laboratoře

  • Vybavení pro charakterizaci, purifikaci a krystalizaci biologick‎ých makromolekul a pro kryogenní uchovávání krystalick‎‎‎‎ých vzorků
  • V‎‎ýpočetní a softwarové vybavení pro zpracování dat rentgenové difrakce, určování 3D struktury a anal‎‎ýzu
  • Měření rtg. difrakce probíhá na pracovištích FZÚ AV ČR, ÚOCHB AV ČR, BTÚ AV ČR a na evropských zdrojích synchrotronového záření (Bessy Berlín, ESRF Grenoble, Elettra Trieste).

 

Umístění v ÚMCH AV ČR: Laboratoře č. 301 a 323, tel. 296809205 nebo 296809390

Podrobnější informace
Webové stránky skupiny:      http://protein.awardspace.com/

Institute of Macromolecular Chemistry AS CR, v.v.i.
Heyrovského nám. 2
CZ-162 06 Praha 6
Czech Republic
phone:+420 296 809 111
fax:+420 296 809 410

Budova UMCH