PRACOVNÍ SKUPINA STRUKTURNÍ ANALÝZY MOLEKUL
English text at old web:
http://www.imc.cas.cz/en/imc/struanal/molstru/
Pracovní skupina pro strukturní analýzu molekulb
Vedoucí: RNDr. Jindřich Hašek, DrSc. (tel. 296 809 205, e-mail: hasek@imc.cas.cz)
Výzkum
Metoda
- Proteinová krystalografie. Rentgenová strukturní analýza makromolekul. Purifikace, krystalizace, měření a vyřešení atomární 3D struktury molekul.
- Doplňkové metody: výzkum makromolekul v roztoku. Vývoj krystalizačních screenů. Počítačové simulace - molekulární dynamika. Systematika a vývoj databází.
Výzkumné projekty
Zabýváme se převážně vztahem struktury a funkce proteinů a jejich komplexů s ligandy, ale i jiných uspořádaných makromolekul schopných krystalizace. Proteiny pro strukturní výzkum jsou většinou připraveny ve spolupracujících laboratořích.
- Extracelulární domény receptorů zabíječských buněk imunitního systému (spolupráce s MBÚ AV ČR, v.v.i. a PřF UK)
- Průmyslově využitelné oxidoreduktázy (spolupráce: firma Novozymes)
- Doposud strukturně necharakterizované enzymy (dvoudoménová lakáza)
- Proteiny operující na DNA/RNA
- Systematické strukturní studie imunoglobulinů
- Chitinolytický komplex enzymů bakterií střevní mikroflory (spolupráce UŽFG AV ČR, v.v.i.)
- Chladově aktivní beta-galaktosidáza (spolupráce: VŠCHT Praha)
- HIV-1 proteáza a její interakce s inhibitory, vliv mutací (spolupráce: ÚOCHB AV ČR)
- Interakce protein - polymer (spolupráce: evropské laboratoře)
Vybavení laboratoře
- Vybavení pro charakterizaci, purifikaci a krystalizaci biologických makromolekul a pro kryogenní uchovávání krystalických vzorků
- Výpočetní a softwarové vybavení pro zpracování dat rentgenové difrakce, určování 3D struktury a analýzu
- Měření rtg. difrakce probíhá na pracovištích FZÚ AV ČR, ÚOCHB AV ČR, BTÚ AV ČR a na evropských zdrojích synchrotronového záření (Bessy Berlín, ESRF Grenoble, Elettra Trieste).
Umístění v ÚMCH AV ČR: Laboratoře č. 301 a 323, tel. 296809205 nebo 296809390
Podrobnější informace
Webové stránky skupiny: http://protein.awardspace.com/