Ústav termomechaniky AV ČR, v. v. i. spolupracuje s vysokými školami a dalšími vědeckými institucemi prostřednictvím těchto společných laboratoří:

Laboratoř modelování fyzikálních a chemických procesů v atmosféře, která je zřízena jako společné pracoviště Ústavu termomechaniky AV ČR a Ústavu fyzikální chemie Jaroslava Heyrovského AV ČR za účelem společného provozování výzkumu v oblasti modelování fyzikálních a chemických procesů v atmosféře a dalších jevů důležitých pro životní prostředí.

Ve společné laboratoři pracují tito naši zaměstnanci:
Vedoucí laboratoře: prof. RNDr. Zbyněk Jaňour, DrSc.
Ing. Zdeněk Zelinger, CSc.
RNDr. Ing. Michal Střižík, Ph.D.
RNDr. Klára Jurčáková, Ph.D.
Ing. Václav Nevrlý

Laboratoř optických měřících metod, která je zřízena jako společné pracoviště Ústavu termomechaniky AV ČR a Technické univerzity v Liberci za účelem společného provozování výzkumu v oblasti experimentálního modelování proudění pomocí moderních optických měřících metod.

Vedoucí laboratoře: Ing. Václav Kopecký, CSc. (TU Liberec)

Laboratoř tkáňové biomechaniky, která je zřízena jako společné pracoviště Ústavu termomechaniky AV ČR a Technické univerzity v Liberci za účelem společného provozování výzkumu v oblasti studia látkové výměny a strukturních změn v kostech a v cévních stěnách při dynamickém zatěžování.

Ve společné laboratoři pracují tito naši zaměstnanci:
Vedoucí laboratoře: prof. Ing. František Maršík, DrSc.
Ing. Světlana Převorovská
Václav Klika