Sekce Optika je zaměřena především na výzkum fyzikálních vlastností klasických a kvantových aspektů šíření optického záření, na výzkum funkčních optických struktur, materiálů a technologií. Ve směru klasické optiky je řešena problematika interferometrie, holografie, koherenčního a statistického chování světelných svazků a fraktálové optiky. Současně jsou rozvíjeny nové moderní přístupy zaměřené na netradiční aplikace zahrnující rentgenovou optiku pro synchrotronní záření, optické systémy a zařízení pro vědeckou sféru, medicínu apod. V oblasti kvantové optiky je výzkum zaměřen na různé typy zdrojů kvantově korelovaných fotonových párů, na experimentální charakterizaci překryvů, ”fidelity” a “purity” kvantových stavů. Současně je řešena problematika detekce a charakterizace slabého a ultraslabého záření až do úrovně jednoho fotonu a problematika kvantové teleportace a klonování. Ve směru funkčních optických struktur a materiálů je realizován výzkum vybraných dopovaných oxidů, jejich povrchů, vícevrstvých systémů, nanostrukturovaných keramik a krystalů. Pozornost je soustředěna na charakterizaci uvedených struktur pomocí optických a nanomechanických metod. Významnou součástí je navazující výzkum a vývoj původních technologií přípravy funkčních optických struktur a materiálů pomocí depozičních metod nízkoteplotního plazmatu a pulzní laserové ablace.
