Laboratoř reparace DNA

Laboratoř pěstování molekul a reparace DNA

Vědecké zaměření | Pracovníci | Řešené projekty | Publikace | TAGIP

Aktuality

TAGIP 1^stAnnual meeting se uskutečnil 4.12. - 5.12. 2006 v Praze. Více informací zde.

Vědecké zaměření

Skupina se zabývá studiem procesů, které vedou k indukci mutací, reparaci a rekombinaci DNA vlivem působení chemického a fyzikálního stresu.

Zkušenosti s klonováním exogenních genů v rostlinách jsou využívány pro optimalizaci sekvence proteinu kapsidy L1 a onkoproteinu E7 lidského papilloma viru pro jejich expresi v rostlinách. Zároveň je studována možnost využití rostlin jako bioreaktoru pro produkci jednořetězcových monoklonálních protilátek. Dále je studována možnost využití mechu Physcomitrella patents pro produkci bioaktivních proteinů.

Pracovníci

Pascale Schlaich, Dita Bohdanecká, Markéta Šmídková, Jitka Brouzdová, Jarda Kozák, Karel Angelis, Marcela Holá

	RNDr. Karel J. Angelis, CSc. vedoucí laboratoře
Ing. Dita Bohdanecká exprese proteinů v rostlinách a jejich purifikace
	Ing. Jitka Brouzdová cílená integrace genů, exprese proteinů v rostlinách
Mgr. Marcela Holá produkce bioaktivních proteinů v mechu Physcomitrella patents
	Mgr. Jaroslav Kozák reparace DNA
Ing. Stanislava Kuviková, PhD. v současné době na mateřské dovolené
	Mgr. Markéta Šmídková cílená exprese proteinů v mechu Physcomitrella patents, proteinů produkce scFv v rostlinách

Řešené projekty

Studium reparace DNA u Arabidopsis thaliana (dvojvláknové zlomy, mezivláknové křížové vazby), GAČR

Cílená integrace genů v rostlinách: vektory, mechanismy a využití pro produkci proteinů, TAGIP 2005-2007

Centrum cílených terapeutik, MŠMT 2005-2009 Abstrakt

Integrovaný výzkum rostlinného genomu, MŠMT 2006-2010

Comet assay and cell array for fast and efficient genotoxicity testing, COMIX 2007-2010

Dokončené projekty

České grantové agentury:

Úloha dvojvláknových zlomů DNA na stabilitu rostlinného genomu, 1996-1998

Analýza rostlinných regulačních systémů pomocí konstitutivní aktivace genů, 1997-1999

Biochemická a genetická citlivost semen na ionizující a mikrovlnné ozáření, 1998-2000

Produkce proteinů lidského papilloma viru (PVP) v transgenních rostlinách pro přípravu perorální vakciny 2000-2002 - Abstrakt

Úloha systémově získané rezistence (SAR) u rostlin během působení genotoxického stresu 2001-2003 - Abstrakt

Studium indukované reparace DNA u Arabidopsis thaliana 2002-2005

Abstrakt

Studium poškození DNA a apoptosy genotoxickým stresem, MŠMT- Kontakt 2002-2005

Abstrakt

Tolerance poškození DNA u rostlin, MŠMT-Kontakt 2002-2003 Abstrakt

Rekombinantní protilátky produkované rostlinami, AV ČR 2003-2005 Abstrakt

Mech Physcomitrella patents jako produkční plodina, GAČR 2004-2006 Abstrakt

DFG (Německo):

Einfluß der Expression von heterologen Proteinen auf DNA Reparatur und Genomstabilität im Tabak, 1997-2000

Potenz und molekulare Grundlagen des Nachweises von Genomschädigungen über „single cell electrophoresis“ (Comet-Assay) bei Pflanzen, 1998-2002

INRA (Francie):

Méchanismes des Résponses aux Stresses Génotoxique chez les Plante, 2002-2004

Vybrané publikace

Friedlender, M., Lev-Yagun, S., Babůrek, I., Angelis, K.J., Levy, A.A. (1996) Cell divisions in cotyledons after germination: localization, time course and utilization for mutagenesis assay. Planta 199:307-313

Babůrek, I., Stibůrková, B., Levy, A.A., Angelis, K.J. (1997) Tobacco cotyledons: A Novel System for Testing Mutagenicity in Plants. Env. Molec. Mutag. 30:91-93

Koppen, G., Angelis, K.J. (1998) Repair of X-ray induced DNA damage measured by comet assay in root tips of Vicia faba. Env. Molec. Mutag. 32:281-285

Angelis, K.J., Dušínská, M., Collins A.R. (1999) Single cell gel electrophoresis; detection of DNA damage at different levels of sensitivity. Electrophoresis 20: 2133-2138

Menke, M., Angelis, K.J., Schubert, I. (2000) Detection of specific DNA lesions by a combination of comet assay and FISH in plants. Env. Molec. Mutag. 35:132-138

Angelis, K.J., McGuffie, M., Menke, M., Schubert, I. (2000) Adaptation to Alkylation Damage in DNA Measured by the Comet assay. Env. Molec. Mutag. 36: 146-150

Menke, M., Cheng, I-P, Angelis, K.J, Schubert, I. (2001) DNA damage and repair in Arabidopsis thaliana as measured by the Comet Assay after treatment with different classes of genotoxins. Mutat. Res. 493: 87-93

Hartung, F., Angelis K.J., Meister, A., Schubert, I., Melzer, M., Puchta, H. (2002) An Archaebacterial Topoisomerase Homolog Not Present in Other Eukaryotes Is Indispensable for Cell Proliferation of Plants. Current Biology 12: 1787-1791.