Při interakci rostliny s patogenem dochází k aktivaci genů a syntéze bílkovin či enzymů podílejících se na obranných reakcích hostitele. Důležitým mechanismem regulace exprese genomu jsou procesy chemické modifikace histonů chromatinu, které jej přeměňují z pevně vinuté, funkčně reprimované struktury (heterochromatin) do relaxované struktury (eurochromatin), která je biologicky aktivní a lehce přístupná pro transkripční faktory. Hlavním krokem v procesu poznání, kdy jsou nebo nejsou geny exprimovány, byl objev methylace histonů, která je iniciačním signálem k útlumu genů a histonmethyltransferasa (HMT), tj. enzym, který je zodpovědný za tuto methylaci, stojí dnes v popředí výzkumného zájmu. Jejím funkčním jádrem je asi 130 aminokyselin dlouhá oblast označovaná jako SET doména.
Základní výzkum laboratoře se zabývá charakterizací a funkcí SET domény u HMT Arabidopsis thaliana a je zaměřen především na dvě nedávno nalezené isoformy u mutantu K23. Tyto isoformy, označované α a β, zřejmě vznikají alternativním střihem RNA. Současným cílem je charakterizace funkce HMT K23 a dalších dvou členů SuvR SET domén a objasnění vztahů mezi isoformami α a β.
Jelikož doménová architektura HMT genu u mutantu K23 je velmi podobná DIM-5 u Neurospora, která je jedinou HMT u tohoto organismu, je rovněž zkoumána možnost komplementace u buněk Neurospora nesoucí mutaci v genu DIM-5. V případě pozitivního výsledku bude možné tento postup použít pro rychlý screening na HMT aktivitu i u jiných rostlinných (živočišných) SET proteinů.
V oblasti cíleného výzkumu se laboratoř zabývá molekulární genetikou rezistence jabloně proti strupovitosti způsobované houbou Venturia inaequalis
Čeština
English
