| Anotace |
Budou připravovány nové modifikované nukleosid trifosfáty (NTP) a studovány jejich polymerasami katalyzované inkorporace do oligonukleotidů a DNA. Modifikace na bázi budou zaměřeny na molekulární sondy (redox-aktivní nebo fluorescenční skupiny) a na chemicky reaktivní skupiny pro biokonjugace (např. tvorba cross-linků s proteiny). Bude studována interakce těchto modifikovaných nukleových kyselin s vybranými proteiny vážícími DNA (např. restrikčními endonukleázami, DNA methyl-transferasami apod.).
Klíčové citace:
1. Raindlová, V.; Pohl, R.; Šanda, M.; Hocek, M. "Direct polymerase synthesis of reactive aldehyde-functionalized DNA and its conjugation and staining with hydrazines" Angew. Chem. Int. Ed. 2010, 49, 1064-1066.
2. Macíčková-Cahová, H.; Hocek, M. "Cleavage of adenine-modified functionalized DNA by type II restriction endonucleases" Nucleic Acids Res. 2009, 37, 7612-7622.
3. Cahová, H.; Havran, L.; Brázdilová, P.; Pivoňková, H.; Pohl, R.; Fojta, M.; Hocek, M. "Aminophenyl- and Nitrophenyl-Labeled Nucleoside Triphosphates. Synthesis, Enzymatic Incorporation and Electrochemical Detection" Angew. Chem. Int. Ed. 2008, 47, 2059-2062.
4. Kielkowski, P.; Macíčková-Cahová, H.; Pohl, R.; Hocek, M. "Transient and switchable (triethylsilyl)ethynyl protection of DNA against cleavage by restriction endonucleases" Angew. Chem. Int. Ed. 2011, 50, 8727-8730.
|
