Ústav fyziky atmosféry AV ČR v. v. i. (ÚFA) byl založen 1. ledna 1964. Výzkumná aktivita v současnosti pokrývá celou atmosféru Země – od přízemní vrstvy až po meziplanetární prostor. Ústav se člení na pět vědeckých oddělení a jednu pracovní skupinu:
- Oddělení meteorologie
- Oddělení klimatologie
- Oddělení aeronomie
- Oddělení horní atmosféry
- Oddělení kosmické fyziky
- Skupina numerických simulací heliosférického plazmatu.