Evropská federace chemického inženýrství je jedna z nejdůležitějších profesních institucí v oboru chemie. Prof. Jiří Drahoš úspěšně vykonával funkci prezidenta již po jedeno (dvouleté) období. V září roku 2007 byl znovuzvolen jako do fuknce prezidenta EFCE na období 2008-2009. Na toto období byl zvolen společně s Doc. Růžičkou, jež se podílí na aktivitách Pracovní skupiny Vícefázových toků EFCE. (EFCE Multiphase Fluid Flow Working Party).