Fyzikální chemie (2009)

Molekulová dynamika umožňuje simulovat přírodní procesy na atomové úrovni. Dlouhou dobu byla omezena na modelování interakcí mezi molekulami. Mnoho důležitých jevů v chemii (elektroforéza, chromatografie) nebo v biologii (iontová výměna v buňkách, přenos nervového signálu) však vyžaduje speciální adaptace dynamických výpočtů, které nejsou součástí dostupných programů. Nedávno tak byla na ÚOCHB poprvé úspěšně simulována chirální separace molekul v kapalinové chromatografii. Cílem práce proto je adaptovat a modifikovat postupy a programy (převážně ve Fortranu a Pascalu) pro dlouhočasové simulace transportních dějů. Jako zcela nový prvek plánujeme zahrnutí vnějších polí do simulací. Simulace chromatografických dějů, zejména chirální separace, bude možné ověřit experimentálně.