Nabídka pro studenty

Stanovení a identifikace chlorovaných uhlovodíků v ekosystému

Podrobnosti zde.

Stanovení a identifikace těkavých chlorovaných uhlovodíků v ekosystému smrkového lesa. Zdokonalování a optimalizace chromatografické metodiky měření těkavých látek pomocí kryofokusace.

Studium exprese rostlinných mitochondriálních genů u modelové rostliny silenka obecná (Silene vulgaris).

      Genom rostlinných mitochondrií se velmi liší od genomu mitochondrií živočišných. Je mnohem větší, probíhá v něm častá intramolekulární rekombinace. Ty často vedou ke vzniku chimerických genů, které jsou složené z různorodých částí. Exprese některých chimér poškozuje funkci mitochondrií a vede k pylové sterilitě (cytoplasmic male sterility CMS). Regulace genové exprese v rostlinných mitochondriích je velmi málo probádaná. Přeskupování bloků DNA vede k vytvoření nových regulačních oblastí a tím ovlivňuje genovou expresi.

Analýza genových regulačních sítí řídících indukci kvetení u krátkodenních merlíků Chenopodium rubrum a C. quinoa

     Principy regulace kvetení byly podrobně objasněny u dlouhodenního modelu Arabidopsis thaliana. Pokusy s krátkodenními druhy (rýže, Pharbitis nil) ukázaly jak shodu ve využití genů ortologních s Arabidopsis thaliana, tak rozdíly ve funkci u některých klíčových genů. V naší laboratoři využíváme tradiční modelové krátkodenní rostliny merlíku červeného (Chenopodium rubrum).

Analýza transkripce mitochondriálních genů u silenky obecné.

     Mitochondriální (mt) genom rostlin se velmi liší od mt genomu živočišného. Je značně velký ( několik set tisíc bp), i když obsahuje přibližně stejný počet genů jako mt genom živočichů. Je také dynamicky proměnlivý, zejména díky častým vnitromolekulárním rekombinacím. Ty vedou i ke změnám regulačních oblastí v těsném sousedství genů. Silenka obecná má mimořádně proměnlivý mt genom. V rámci jednoho druhu zahrnuje různé haplotypové linie se zcela odlišnými oblastmi na 5´konci esenciálních mt genů, což je i mezi rostlinámi vzjimečný jev.

Studium genetických základů kvetení u merlíku červeného a merlíku quinoa

Studium genetických základů kvetení  u merlíku červeného a merlíku quinoa