Akademická rada Akademie věd ČR udělila v roce 2005 tyto medaile:
Čestnou medaili „De scientia et humanitate optime meritis“
- prof. Ing. Ivo Babuškovi, DrSc., Dr.h.c., z University of Texas at Austin, USA
- prof. RNDr. Petru Hájkovi, DrSc., vědeckému pracovníku Ústavu informatiky AV ČR
- prof. Ing. Jaroslavu Janákovi, DrSc., Dr.h.c., vědeckému pracovníku Ústavu analytické chemie AV ČR
- Prof. Norbert Kroóvi, generálnímu sekretáři Maďarské akademie věd, Maďarsko
- Zdeňku Mácalovi, šéfdiregentu České filharmonie, Praha
- Prof. Ing. Ivanu Wilhelmovi, CSc. - rektorovi Univerzity Karlovy, Praha
Čestnou oborovou medaili B. Bolzana za zásluhy v matematických vědách
- prof. RNDr. Radkovi Mesiarovi, CSc., ze Stavebné fakulty STU, Bratislava, SR
- prof. RNDr. Jaroslavu Peregrinovi, CSc., vědeckému pracovníku Filozofického ústavu AV ČR
Čestnou oborovou medaili E. Macha za zásluhy ve fyzikálních vědách
- prof. Dr. Alexandrovi Jablonskému z Polské akademie věd
- RNDr. Františku Kroupovi, DrSc., vědeckému pracovníku Ústavu fyziky plazmatu AV ČR
- prof. Andrewu Richardu Langovi, PhD., FRS., z University of Bristol, Velká Britanie
- prof. Guido Van Oostovi, PhD, z Ghent University, Belgie
Čestnou oborovou medaili F. Pošepného za zásluhy v geologických vědách
- doc. RNDr. Pavlu Povondrovi, DrSc., vědeckému pracovníku Geologického ústavu AV ČR
Čestnou oborovou medaili G. J. Mendela za zásluhy v biologických vědách
- Prof. Dr. Georgu Kleinovi z Microbiology and Tumor Biology Center, Karolinska Institutet, Švédsko
- prof. RNDr. Ivanu Raškovi, DrSc., vědeckému pracovníku Ústavu experimentální medicíny AV ČR
- prof. MUDr. Jaroslavu Šterzlovi, DrSc., vědeckému pracovníku Mikrobiologického ústavu AV ČR
Čestnou oborovou medaili J. E. Purkyně za zásluhy v biologických vědách
- Dr. Mikulasi Popovicovi z Institute of Human Virology, Baltimore, USA
Čestnou oborovou medaili J. Dobrovského za zásluhy ve společenských vědách
- PhDr. Martě Bečkové, CSc., vědecké pracovnici Filozofického ústavu AV ČR
- Dr. Aleksandru Ilićovi, bývalému velvyslanci Srbska a Černé Hory v ČR
Pamětní medaili Jana Patočky
- PhDr. Františku Hoffmannovi, CSc., vědeckému pracovníku Archivu AV ČR
- RNDr. Vladimíru Petrusovi, CSc., řediteli Kanceláře Akademie věd ČR
- RNDr. Janě Šlotové, CSc., vědecké pracovnici Biofyzikálního ústavu AV ČR
Čestnou medaili V. Náprstka za zásluhy v popularizaci vědy
- Dipl. Pol. Dr. Werneru Korthaasovi, Deutsche Comenius-Gesellschaft e.V., Berlin, SRN
- MUDr. Františku Koukolíkovi, DrSc., z Fakultní Thomayerovy nemocnice v Praze
- prof. RNDr. Ivo Krausovi, DrSc., z Fakulty jaderné a fyzikálně inženýrské ČVUT v Praze
