Centre of Plant Structural and
Functional Genomics
of the Institute of Experimental Botany AS CR

Téma:

Analýza buněčného cyklu rostlin pomocí průtokové cytometrie

Vedoucí práce: Mgr. Jan Vrána, Ph.D.

tel.: 585 238 720

email.: vranaueb [dot] cas [dot] cz

Obecný úvod:

Dělení buněk je základní přírodní proces a skládá se z několika základních fází (G1, S, G2/M), které se liší různým obsahem DNA. Metoda zvaná průtoková cytometrie dokáže tyto fáze rozlišit. Pomocí nové metody detekce syntézy DNA v jádře je možné sledovat kinetiku buněčného cyklu, analyzovat genotoxicitu chemikálií a odezvu buněk na různé stresy, ad.

Předpokládaná pracovní náplň:

• Literární rešerše
• Příprava vzorků rostlinných jader
• Analyzování jader průtokovou cytometrií

Seznam doporučené literatury:

•      Doležel J, Greilhuber J, Suda J: Flow cytometry with plants: an overview. In: Doležel J, Greilhuber J, Suda J, editors. Flow cytometry with plant cells. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, Weinheim. 41–65 (2007).
•      Kotogány E, Dudits D, Horváth GV, Ayaydin F: A rapid and robust assay for detection of S-phase cell cycle progression in plant cells and tissues by using ethynyl deoxyurudine. Plant Methods 6:5 (2010).
•      Buck SB, Bradford J, Gee KR, Agnew BJ, Clarke ST, Salic A: Detection of S-phase cell cycle progression using 5-ethynyl-2’-deoxyuridine incorporation with click chemistry, an alternative to using 5-bromo-2’- deoxyuridine antibodies. BioTechniques 44:927-9 (2008).

Obr. 1. Analýza buněčného cyklu jader ječmene cv. Morex pomocí průtokového cytometru za současného měření obsahu DNA v jádře (osa X) a míry syntézy DNA (osa Y).