Předseda Akademie věd ČR udělil v roce 2009 tyto medaile:
Čestnou medaili AV ČR "De scientia et humanitate optime meritis"
- RNDr. Zdeňku Ceplechovi, DrSc., z Astronomického ústavu AV ČR, v. v. i.
- prof. Erazimu Kohákovi, PhD., z Filosofického ústavu AV ČR, v. v. i.
- prof. Terence G. Langdonovi, PhD., DSc., Dr.h.c., z University of Southern California, USA
- prof. RNDr. Emilu Palečkovi, DrSc., z Biofyzikálního ústavu AV ČR, v. v. i.
- doc. RNDr. Luboši Perekovi, DrSc., z Astronomického ústavu AV ČR, v. v. i.
- prof. PhDr. Františku Šmahelovi, DrSc., Dr.h.c.mult, z Filosofického ústavu AV ČR, v. v. i.
Čestnou oborovou medaili Ernsta Macha za zásluhy ve fyzikálních vědách
- prof. Patricku Brunovi, PhD., z European Synchrotron Radiation Facility, Francie
- Ing. Vratislavu Kafkovi, DrSc., z Ústavu teoretické a aplikované mechaniky AV ČR, v. v. i.
Čestnou oborovou medaili Františka Křižíka za zásluhy v oblasti technických věd a za realizaci výsledků vědeckého výzkumu
- prof. Ing. Ondřeji Fischerovi, DrSc., z Ústavu teoretické a aplikované mechaniky AV ČR, v. v. i.
- prof. Ing. Ladislavu Frýbovi, DrSc., Dr.h.c., z Ústavu teoretické a aplikované mechaniky AV ČR, v. v. i.
- prof. Otto S. Wolfbeisovi, PhD., z University of Regensburg, Německo
Čestnou oborovou medaili Jaroslava Heyrovského za zásluhy v chemických vědách
- Ing. Blance Wichterlové, DrSc., z Ústavu fyzikální chemie Jaroslava Heyrovského AV ČR, v. v. i.
Čestnou oborovou medaili Gregora Johanna Mendela za zásluhy v biologických vědách
- prof. Davidu L. Baltimore, Ph.D., z California Institute of Technology, Pasadena, USA
- prof. Jamesi H. McKerrowi, z University of California, San Francisco, USA
Čestnou oborovou medaili Jana Evangelisty Purkyně za zásluhy v biomedicínských vědách
- prof. Asle Pitkänen, MD, PhD., DSc., z University of Kuopio, Finsko
- prof. MUDr. Josefu Sykovi, DrSc., z Ústavu experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Čestnou oborovou medaili Karla Engliše za zásluhy v sociálních a ekonomických vědách
- doc. JUDr. Josefu Blahožovi, DrSc., z Ústavu státu a práva AV ČR, v. v. i.
Čestnou oborovou medaili Františka Palackého za zásluhy v historických vědách
- prof. Dr. Zdeňku V. Davidovi, z Woodrow Wilson International Centrer for Scholars, Washington DC, USA
- prof. Dr. Anne Hudson, FBA z University of Oxford, Lady Margaret Hall, Velká Británie
Pamětní medaili Jana Patočky
- prof. JUDr. Monice Pauknerové, CSc., z Ústavu státu a práva AV ČR, v. v. i.
Čestnou medaili Vojtěcha Náprstka za zásluhy v popularizaci vědy
- Sylvě Daníčkové, prom.historičce
- PhDr. Jindře Jarošové, z Českého rozhlasu, Praha
- RNDr. Františku Kotlabovi, CSc., z Botanického ústavu AV ČR, v. v. i.
- Michaelu Londesboroughovi, Dr., z Ústavu anorganické chemie AV ČR, v. v. i.
Čestnou medaili Za zásluhy o Akademii věd České republiky
- JUDr. Janu Bártovi, CSc., z Ústavu státu a práva AV ČR, v. v. i.
- Karlu Melicharovi, z Fyzikálního ústavu AV ČR, v. v. i.
- prof. Ing. Jiřímu Niederlemu, DrSc., z Fyzikálního ústavu AV ČR, v. v. i.
- Miroslavu Hudečkovi, z Fyzikálního ústavu AV ČR, v. v. i. (in memoriam)
- Boženě Šléglové z Kanceláře Akademie věd
