Fyzikální chemie

Školitel RNDr. Luboš Rulíšek, Ph.D.
Skupina

Luboš Rulíšek

Téma Počítačový design minimalistických metalopeptidů jako cesta k rozluštění katalytické účinnosti metaloproteinů
Fakulta FCHI / FPBT VŠCHT
Anotace

Cílem projektu je počítačový design malých katalytických metalopeptidů a vysoce specifických chelatujících peptidů. Postup je založen na vývoji zcela nových a unikátních programů, které operují nad databází peptidových fragmentů získaných z Protein Data Bank a spojují tyto fragmenty do předem definovaného peptidového řetězce - se shodnou strukturou, jakou má aktivní místo metaloproteinu. Rovněž bude vytvořeno propojení s externími QM či QM/MM programy, které umožní teoretickou verifikaci možných katalytických vlastností nalezených struktur.