Offer for students

Alternativní dráhy zapojené do snižování hladin a aktivit cytokininů v rostlinách

Cytokininy jsou rostlinné růstové regulátory, které mají významnou úlohu při řízení buněčného cyklu a ovlivňují řadu růstových a vývojových procesů jako diferenciaci buněk a chloroplastů, apikální dominanci a senescenci. V rámci doktorské disertace budou studovány dráhy a mechanismy, jimiž jsou down-regulovány koncentrace a aktivity cytokininů v rostlinách.

Úloha transkripčních faktorů rodiny bZIP při vývoji a zrání pylu

Vývoj a funkce samčího gametofytu představuje velice specifický a přesně kontrolovaný vývojový proces, kterého se účastní celá řada genů. Cílem diplomové práce bude rozšíření znalostí o spektru procesů, které transkripční faktory rodiny bZIP v pylu regulují.

Regulace translace v pylu a pylových láčkách

Genová exprese (nejen) u rostlin je regulována na mnoha úrovních. Cílem práce je detailní strukturní a funkční charakterizace multifunkčních ribonukleoproteinových komplexů popsaných u pylu včetně zkoumání dynamiky jejich složení a lokalizace.

Pylové -omiky

Razantní nástup vysoce výkonných (-omických: zejména transkriptomika, proteomika) metodických přístupů na přelomu tisíciletí se odrazil i ve výzkumu samčího gametofytu, pylu a pylové láčky, a jeho interakcí s gametofytem samičím.

Funkční genetika pylu

Vývoj a funkce samčího gametofytu, tj. zrání pylového zrna a následný růst pylové láčky k vajíčku, představuje velice specifický a přesně kontrolovaný vývojový proces, který je dosud málo prostudovaný

Skladování a transport mRNA v rostlinných buňkách

Skladování, transport a lokalizovaná translace mRNA představuje mocný nástroj kontroly genové exprese

Translace v neuronech a pylových láčkách

Samčí gametofyt semenných rostlin představuje velice redukovanou a specializovanou strukturu.
Forma skladování a aktivace mRNA v ní je analogická fenoménu popsanému u rostoucích nervových buněk obratlovců

Translace a její regulace u rostlin

Genová exprese (nejen) u rostlin je regulována na mnoha úrovních. Výborným a jednoduchým modelem studia je rostoucí pylová láčka.

Localisation of stored mRNA a its translation in pollen and pollen tubes

Supervisor: RNDr. David Honys, Ph.D.
Consultant: RNDr. Věra Čapková, CSc., Said Hafidh, Ph.D. 

Mechanisms of auxin signal transduction: Components of nongenomic response mediated by the auxin receptor ABP1

Mechanismus vazby fytohormonu auxinu na předpokládaný receptor Auxin Binding Protein 1“ (ABP1) je znám již mnoho let a jsou známé i mnohé navazující procesy (Sauer & Kleine-Vehn, 2011). Některé z těchto procesů probíhají téměř bezprostředně po interakci auxinu s ABP1 a nezahrnují aktivaci genové exprese a transkripci.  Příkladem je regulace cyklování některých transportérů auxinu z rodiny PIN mezi plasmatickou membránou a endosomy (Robert et al. 2010).