Identifikace molekulárních markerů v "NextGen" sekvenačních datech druhu Agropyron cristatum

Téma:

Identifikace molekulárních DNA markerů v "NextGen" sekvenačních datech druhu Agropyron cristatum

Téma anglicky:

Identification of DNA molecular markers in NextGen sequencing data of Agropyron cristatum


Vedoucí práce: Mgr. Eva Hřibová, PhD.

tel.: 585 238 713

email.: hribovaatueb [dot] cas [dot] cz

Zásady pro vypracování:

  • Vypracování literárního přehledu o používaných sekvenačních metodách nové generace a jejich aplikaci pro identifikaci molekulárních markerů
  • Navržení specifických primerů vhodných pro experimentální ověření in silico identifikovaných molekulárních DNA markerů ověření a identifikace chromozomově specifických markerů v adičních liniích nesoucích jednotlivé chromozomy druhu A. cristatum pomocí PCR
  • Ověření a identifikace chromozomově specifických markerů v adičních liniích nesoucích jednotlivé chromozomy druhu A. cristatum pomocí PCR; vyhodnocení a porovnání získaných výsledků.