Genová exprese (nejen) u rostlin je regulována na mnoha úrovních. Cílem práce je detailní strukturní a funkční charakterizace multifunkčních ribonukleoproteinových komplexů popsaných u pylu včetně zkoumání dynamiky jejich složení a lokalizace.
Školitel: RNDr. David Honys, Ph.D.
Konzultant: RNDr. Věra Čapková, CSc., Said Hafidh, Ph.D.
Předběžná náplň práce:
Genová exprese (nejen) u rostlin je regulována na mnoha úrovních. Mimo základní úrovně transkripční je to zejména translace, která dokáže mnohem operativněji reagovat na aktuální fyziologický stav buňky, a to jednak kontrolovanou aktivací příslušných transkriptů a jednak jejich správnou lokalizací. Skladování, transport a lokalizovaná translace mRNA tak představuje mocný nástroj kontroly genové exprese účastnící se mj. klíčových regulačních procesů morfogeneze (např. květní indukce semenných rostlin či déle známá embryogeneze octomilky). Výtečným jednoduchým a v naší laboratoři zavedeným modelem studia regulace translace je samčí gametofyt, pyl a polárně rostoucí pylová láčka, u nichž se snoubí fenomény skladování mRNA, jejího transportu a lokalizované translace: molekuly mRNA kódující láčkové bílkoviny jsou skladované v obrovském množství ve formě specifických ribonukleoproteinových částic, které jsou bezprostředně po vyklíčení pylu transportovány na místo určení (do špičky) a průběžně translačně aktivovány. V naší laboratoři bylo zjištěno, že právě tato forma skladování a aktivace mRNA popsaná u pylu je analogická fenoménu známému u rostoucích nervových buněk obratlovců. Cílem práce bude detailní strukturní a funkční charakterizace multifunkčních ribonukleoproteinových komplexů popsaných u pylu včetně zkoumání dynamiky jejich složení a lokalizace. K tomu budou využity tradiční i moderní metodické přístupy molekulární i buněčné biologie nevyjímaje transkriptomiku a proteomiku.
Téma je řešeno v rámci projektu GAČR, v jehož jsou také pro studenta alokovány mzdové prostředky.
Čeština
English