Výzkum laboratoře je zaměřen na odpovědi rostlin na různé abiotické stresy (především na ty, související s globální změnou klimatu: zvýšená koncentrace CO2, sucho a UV-záření, a na vysokou nebo nízkou teplotu a těžké kovy) a na biotické stresy (stárnutí, vysoký obsah CK, virová infekce) působících jednotlivě i v různých kombinacích.
Zjišťovány jsou změny fyziologických a strukturních charakteristik na úrovni celých rostlin a listů , jednotlivých buněk i buněčných organel. Jedná se především o měření výměny plynů, vodního režimu, stanovení složení a funkce fotosyntetického aparátu a jiných buněčných organel, sledování tvorby aktivních forem kyslíku, oxidativního poškození a indukce biosyntézy ochranných pigmentů a antioxidačních enzymů. Dále jsou detekovány změny v metabolismu reaktivních forem dusíku během přirozené a stresem indukované senescence.
Sledovány jsou jak bezprostřední reakce rostlin na změnu určitého faktoru, tak průběh aklimace a de-aklimace (post-efekty působení stresu).
Významným směrem je ovlivnění reakcí rostlin na stresy působením exogenních a endogenních fytohormonů, zejména ABA a CK.