Téma:

Využití ITS1-5.8S-ITS2 mezerníku pro studium molekulární fylogeneze a diverzity vybraných druhů banánovníku

Vedoucí práce: Mgr. Eva Hřibová, PhD.

tel.: 585 238 713

email.: hribovaueb [dot] cas [dot] cz

Zásady pro vypracování:

• Vypracování literárního přehledu o diverzitě banánovníku a metodik používaných v molekulární fylogenetice
• Izolace genomové DNA, PCR amplifikace, klonování a sekvenování ITS oblasti u vybraných zástupců rodu Musa nově popsaných na území Indonésie
• Analýza získaných DNA sekvencí a jejich využití ke studiu příbuznosti vybraných zástupců čeledi Musaceae

Seznam doporučené literatury:

• Cvrčková F. Úvod do praktické bioinformatiky. Academia, 2006.e
• The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to DNA and Protein Phylogeny. Marco Salemi, Anne-Mieke Vandamme. Cambridge University Press, 2003
• Alvarez I, Wendel JF (2003) Ribosomal ITS sequences and plant phylogenetic inference. Molecular Phylogenetics and Evolution 29: 417-434.
• ITS1-5.8S-ITS2 sequence region in the Musaceae: structure, diversity and use in molecular phylogeny. PloS ONE 6: e17863, 2011. doi:10.1371/journal.pone.0017863.