Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

0427917 - UOCHB-X 2015 RIV ZA eng J - Článek v odborném periodiku
Nair, J. J. - Pošta, Martin - Papenfus, H. B. - Munro, O. Q. - Beier, Petr - van Staden, J.
Synthesis, X-ray structure determination and germination studies on some smoke-derived karrikins.
South African Journal of Botany. Roč. 91, Mar (2014), s. 53-57. ISSN 0254-6299
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: germination * karrikin * plant growth regulator * smoke * X-ray
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 1.340, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233501

0427678 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nauš, Petr - Caletková, Olga - Konečný, P. - Džubák, P. - Bogdanová, K. - Kolář, M. - Vrbková, J. - Slavětínská, Lenka - Tloušťová, Eva - Perlíková, Pavla - Hajdúch, M. - Hocek, Michal
Synthesis, Cytostatic, Antimicrobial, and Anti-HCV Activity of 6-Substituted 7-(Het)aryl-7-deazapurine Ribonucleosides.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 57, č. 3 (2014), s. 1097-1110. ISSN 0022-2623
Grant CEP: GA ČR GAP207/11/0344; GA TA ČR(CZ) TE01020028
Grant ostatní: Operational Programme Research and Development for Innovations(XE) CZ.1.05/2.1.00/01.0030
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: adenosine-kinase-inhibitors * cross-coupling reactions * cytotoxic nucleoside analogs
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 5.480, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233200

0431487 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Navrátil, Michal - Ptáček, Jakub - Šácha, Pavel - Starková, Jana - Lubkowski, J. - Bařinka, Cyril - Konvalinka, Jan
Structural and biochemical characterization of the folyl-poly-gamma-L-glutamate hydrolyzing activity of human glutamate carboxypeptidase II.
FEBS Journal. Roč. 281, č. 14 (2014), s. 3228-3242. ISSN 1742-464X
Grant CEP: GA ČR GAP304/12/0847; GA MŠk(CZ) ED1.1.00/02.0109
Grant ostatní: OPPC(CZ) CZ.2.16/3.1.00/24016
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:86652036
Klíčová slova: arene-binding site * crystal structure * folate hydrolase 1 * H475Y(1561C -> T) * polymorphism * zinc metalloprotease
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.986, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0236127

0431504 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Németh, E. - Körtvélyesi, T. - Thulstrup, P. W. - Christensen, H. E. M. - Kožíšek, Milan - Nagata, K. - Czene, A. - Gyurcsik, B.
Fine tuning of the catalytic activity of colicin E7 nuclease domain by systematic N-terminal mutations.
Protein Science. Roč. 23, č. 8 (2014), s. 1113-1122. ISSN 0961-8368
Grant ostatní: Seventh Framework Programme of the European Union(XE) FP7-312284; OPPC(CZ) CZ.2.16/3.1.00/24016
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA cleavage * flow linear dichroism * isothermal calorimetry * positively charged N-terminal residues * Zn2+ binding
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 2.861, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0236179

0429710 - UOCHB-X 2015 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Nencka, Radim - Hřebabecký, Hubert - Šála, Michal - Dejmek, Milan
Nízkomolekulární inhibitory replikace enterovirů.
[Low-molecular-weight Inhibitors of Enterovirus Replication.]
Chemické listy. Roč. 108, č. 4 (2014), s. 326-334. ISSN 0009-2770
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: enteroviruses * antivirals * inhibitors of virus replication
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 0.196, rok: 2013
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234793

0428926 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Nencka, Radim - Šála, Michal - Hřebabecký, Hubert - Procházková, Eliška - Mackman, R. - Barauskas, O. - Lee, Y. J. - Tian, Y.
Novel conformationally locked nucleosides and nucleotides.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 119-122 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant CEP: GA ČR GPP207/12/P625; GA MV VG20102015046
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: locked nucleoside analogues * oligonucleotide synthesis
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Nencka, Radim
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234281

0427644 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Nishino, N. - Hollingsworth, S. A. - Stern, A. C. - Roeselová, Martina - Tobias, D. J. - Finlayson-Pitts, B. J.
Interactions of gaseous HNO3 and water with individual and mixed alkyl self-assembled monolayers at room temperature.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 16, č. 6 (2014), s. 2358-2367. ISSN 1463-9076
Grant CEP: GA MŠk ME09064
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: organic surface * molecular dynamics * nitric acid deprotonation
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.198, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233165

0427822 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ogrocká, A. - Polanská, P. - Majerová, E. - Janeba, Zlatko - Fajkus, Jiří - Fojtová, M.
Compromised telomere maintenance in hypomethylated Arabidopsis thaliana plants.
Nucleic Acids Research. Roč. 42, č. 5 (2014), s. 2919-2931. ISSN 0305-1048
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GAP501/11/0596; GA MŠk(CZ) ED1.1.00/02.0068
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68081707
Klíčová slova: DNA methylation * cytosine methylation * mammalian telomeres
Kód oboru RIV: CE - Biochemie; BO - Biofyzika (BFU-R)
Impakt faktor: 8.808, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233368

0427760 - UFCH-W 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Olšinová, Marie - Jurkiewicz, Piotr - Pozník, M. - Šachl, Radek - Prausová, T. - Hof, Martin - Kozmik, V. - Teplý, Filip - Svoboda, J. - Cebecauer, Marek
Di- and tri-oxalkyl derivatives of a boron dipyrromethene (BODIPY) rotor dye in lipid bilayers.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 16, č. 22 (2014), s. 10688-10697. ISSN 1463-9076
Grant CEP: GA ČR GAP305/11/0459
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: PLASMA-MEMBRANE VESICLES * MOLECULAR ROTOR * FLUORESCENCE POLARIZATION
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.198, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233255

0429485 - UOCHB-X 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Opekar, Stanislav - Pohl, Radek - Beran, Pavel - Rulíšek, Lubomír - Beier, Petr
Diethyl Fluoronitromethylphosphonate: Synthesis and Application in Nucleophilic Fluoroalkyl Additions.
Chemistry - A European Journal. Roč. 20, č. 5 (2014), s. 1453-1458. ISSN 0947-6539
Grant CEP: GA ČR GP203/08/P310
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: C1 building blocks * fluorine * nucleophilic addition * phosphanes * synthetic methods
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 5.696, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234608

0429324 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Orság, Petr - Pivoňková, Hana - Riedl, Jan - Hocek, Michal - Fojta, Miroslav
Utilisation of enzymatic labelling with 4-aminophtalimide and 4-hydroxybenzylideneimidazolinone fluorescent derivates for monitoring of DNA-protein interaction.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 340-341 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant CEP: GA ČR GBP206/12/G151; GA ČR(CZ) GAP301/11/2076
Grant ostatní: MŠMT(CZ) CZ.1.07/2.3.00/30.0019
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68081707
Klíčová slova: DNA-protein interaction * API * HBI
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie; BO - Biofyzika (BFU-R)
Orság, Petr
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234541

0429833 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pandiyan, B. V. - Kolandaivel, P. - Deepa, Palanisamy
A theoretical perspective of the nature of hydrogen-bond types - the atoms in molecules approach.
Molecular Physics. Roč. 112, č. 12 (2014), s. 1609-1623. ISSN 0026-8976
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: hydrogen bond * proton affinity * deprotanation enthalpy * atoms in molecules * chemical shift
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 1.642, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234952

0428833 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Panova, Natalya - Zborníková, Eva - Šimák, Ondřej - Krásný, Libor - Kolář, M. - Látal, T. - Seydlová, G. - Rejman, Dominik
Insights into the mechanism of action of bactericidal lipophosphonoxins.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 115-118 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant CEP: GA TA ČR TA02010035
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GP13-18051P
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: lipophosphonoxins * cytotoxicity * antibiotics
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234279

0428641 - UOCHB-X 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Parkan, K. - Pohl, Radek - Kotora, M.
Cross-Coupling Reaction of Saccharide-Based Alkenyl Boronic Acids with Aryl Halides: The Synthesis of Bergenin.
Chemistry - A European Journal. Roč. 20, č. 15 (2014), s. 4414-4419. ISSN 0947-6539
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GPP207/12/P713; GA ČR(CZ) GA13-15915S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: CC coupling * glycosides * natural products * protecting groups * synthetic methods
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 5.696, rok: 2013
Parkan, K.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233955

0429024 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Páv, Ondřej - Zborníková, Eva - Buděšínský, Miloš - Rosenberg, Ivan
Phosphanucleosides containing 1-hydroxymethylphospholane 1-oxide ring.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 344-345 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant CEP: GA ČR GA13-26526S; GA ČR GA13-24880S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: phosphanucleosides * 1-hydroxymethylphospholane 1-oxide ring * biological activity
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234439

0429827 - UMCH-V 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pechar, Michal - Pola, Robert - Laga, Richard - Braunová, Alena - Filippov, Sergey - Bogomolova, Anna - Bednárová, Lucie - Vaněk, O. - Ulbrich, Karel
Coiled coil peptides and polymer-peptide conjugates: synthesis, self-assembly, characterization and potential in drug delivery systems.
Biomacromolecules. Roč. 15, č. 7 (2014), s. 2590-2599. ISSN 1525-7797
Grant CEP: GA ČR GCP207/12/J030
Grant ostatní: AV ČR(CZ) Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:61389013 ; RVO:61388963
Klíčová slova: coiled coil * self-assembly * hydrophilic polymer
Kód oboru RIV: CD - Makromolekulární chemie; FR - Farmakologie a lékárnická chemie (UOCHB-X)
Impakt faktor: 5.788, rok: 2013
Pechar, Michal
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0235726

0429038 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Perlíková, Pavla - Pedersen, E. B. - Wengel, J.
5-(Pyren-1-yl)uracil UNA monomers: Synthesis, hybridization studies and i-motif stability.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 346-347 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant ostatní: European Research Council(XE) FP7-268776
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: 5-(pyren-1-yl)uracil UNA monomers * DNA * unlocked nucleic acids
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234441

0427579 - UOCHB-X 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Perlíková, Pavla - Karlsen, K. K. - Pedersen, E. B. - Wengel, J.
Unlocked Nucleic Acids with a Pyrene-Modified Uracil: Synthesis, Hybridization Studies, Fluorescent Properties and i-Motif Stability.
Chembiochem. Roč. 15, č. 1 (2014), s. 146-156. ISSN 1439-4227
Grant ostatní: European Research Council(XE) FP7-268776
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: fluorescence * i-motifs * nucleic acid hybridization * oligonucleotides * unlocked nucleic acids
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.060, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233146

0429040 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Petrová, Magdalena - Buděšínský, Miloš - Zborníková, Eva - Panova, Natalya - Novák, Pavel - Rosenberg, Ivan
Activation of human RNase L by 5’-C-phosphonate-modified oligoadenylates.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 348-349 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant CEP: GA ČR GA13-26526S; GA ČR GA13-24880S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: human RNase L * oligoadenylates
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234442

0427646 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pinardi, A. L. - Martínez, J. I. - Jančařík, Andrej - Stará, Irena G. - Starý, Ivo - Lopez, M. F. - Méndez, J. - Martin-Gago, J. A.
Sequential formation of N-doped nanohelicenes, nanographenes and nanodomes by surface-assisted chemical (cyclo)dehydrogenation of heteroaromatics.
Chemical Communications. Roč. 50, č. 13 (2014), s. 1555-1557. ISSN 1359-7345
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP207/10/2207
Grant ostatní: Operational Program Research and Development for Innovations(XE) FP7-604391
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: dibenzohelicene * UHV-STM * Pt(111)
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 6.718, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233167

0430619 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pluhařová, Eva - Baer, M. D. - Mundy, C. J. - Schmidt, B. - Jungwirth, Pavel
Aqueous Cation-Amide Binding: Free Energies and IR Spectral Signatures by Ab Initio Molecular Dynamics.
Journal of Physical Chemistry Letters. Roč. 5, č. 13 (2014), s. 2235-2240. ISSN 1948-7185
Grant CEP: GA MŠk LH12001
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: sodium * calcium * N -methylacetamide * peptide bond * umbrella sampling
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 6.687, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0235575

0429520 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pluhařová, Eva - Fischer, H. E. - Mason, Philip E. - Jungwirth, Pavel
Hydration of the chloride ion in concentrated aqueous solutions using neutron scattering and molecular dynamics.
Molecular Physics. Roč. 112, 9/10 (2014), s. 1230-1240. ISSN 0026-8976
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016; GA MŠk LH12001
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) LM2010005
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: lithium * solution * molecular dynamics * chloride * neutron scattering
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 1.642, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234686

0429051 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Pohl, Radek - Poštová Slavětínská, Lenka - Rejman, Dominik
Pyrrolidine nucleotides conformationally constrained via hydrogen bonding.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 352-353 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant CEP: GA ČR GA13-24880S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: pyrrolidine nucleotides * PMEA * hydrogen bond
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Pohl, Radek
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234443

0430382 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Položij, M. - Thang, H. V. - Rubeš, Miroslav - Eliášová, Pavla - Čejka, Jiří - Nachtigall, P.
Theoretical investigation of layered zeolites with MWW topology: MCM-22P vs. MCM-56.
Dalton Transactions. Roč. 43, č. 27 (2014), s. 10443-10450. ISSN 1477-9226
Grant CEP: GA ČR GBP106/12/G015; GA ČR(CZ) GP14-18521P
Grant ostatní: Seventh Framework Programme of the European Union(XE) FP7-604307; GA MŠk(CZ) LM2010005; GA MŠk(CZ) ED3.2.00/08.0144
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: initio molecular dynamics * total energy calculations * wave basis set
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.097, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0235357

0431673 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pospíšil, Lubomír - Bednárová, Lucie - Štěpánek, Petr - Slavíček, P. - Vávra, Jan - Hromadová, Magdaléna - Dlouhá, Helena - Tarábek, Ján - Teplý, Filip
Intense Chiroptical Switching in a Dicationic Helicene-Like Derivative: Exploration of a Viologen-Type Redox Manifold of a Non-Racemic Helquat.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 136, č. 31 (2014), s. 10826-10829. ISSN 0002-7863
Grant CEP: GA ČR GA13-19213S
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GA13-34168S; GA MŠk(CZ) ED3.2.00/08.0144
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: optical properties * asymmetric synthesis * chirality
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 11.444, rok: 2013
Pospíšil, Lubomír
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0236408

0429056 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Poštová Slavětínská, Lenka - Pohl, Radek - Rejman, Dominik
Conformation analysis of nucleoside analogues containing selenium and tellurium in five-membered pseudosugar ring.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 354-355 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant CEP: GA ČR GA13-24880S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: nucleoside analogues * five-membered pseudosugar ring * NMR
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234444

0431792 - UOCHB-X 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Poštová Slavětínská, Lenka - Rejman, Dominik - Pohl, Radek
Pyrrolidine nucleotide analogs with a tunable conformation.
Beilstein Journal of Organic Chemistry. Roč. 10, Aug 22 (2014), s. 1967-1980. ISSN 1860-5397
Grant CEP: GA ČR GA13-24880S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: conformation * NMR * nucleic acids * nucleotide analog * phosphonic acid * pseudorotation * pyrrolidine
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 2.803, rok: 2013
http://www.beilstein-journals.org/bjoc/single/articleFullText.htm?publicId=1860-5397-10-205
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0236420

0429111 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Procházková, Eliška - Hřebabecký, Hubert - Nencka, Radim - Dračínský, Martin
Enzymatic decomposition of a locked nucleoside phosphoramidate monitored by 31P NMR spectroscopy.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 356-357 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant CEP: GA ČR GA13-24880S; GA ČR GPP207/12/P625
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: phosphoramidate derivatives * enzymatic hydrolysis * NMR spectroscopy
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234445

0428941 - UOCHB-X 2015 CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Procházková, Eliška - Čechová, Lucie - Žurek, Jiří - Janeba, Zlatko - Dračínský, Martin
Switchable intramolecular hydrogen bond in polysubstituted 5-nitrosopyrimidines.
Chemistry of Nucleic Acid Components. 16th Symposium. Praha : Institute of Organic Chemistry and Biochemistry AS CR, v. v. i, 2014 - (Hocek, M.), s. 251-254 ISBN 978-80-86241-50-0. - (Collection Symposium Series. 14).
[Symposium on Chemistry of Nucleic Acid Components /16./. Český Krumlov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
Grant CEP: GA ČR GA13-24880S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: intramolecular hydrogen bonds * polysubstituted 5-nitrosopyrimidines * NMR spectroscopy
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234285

0431519 - UOCHB-X 2015 DE eng J - Článek v odborném periodiku
Prosser, C. E. - Waters, L. C. - Muskett, F. W. - Veverka, Václav - Addis, P. W. - Griffin, L. M. - Baker, T. S. - Lawson, A. D. G. - Wernery, U. - Kinne, J. - Henry, A. J. - Taylor, R. J. - Carr, M. D.
N-15, C-13 and H-1 resonance assignments and secondary structure determination of a variable heavy domain of a heavy chain antibody.
Biomolecular NMR Assignments. Roč. 8, č. 1 (2014), s. 113-116. ISSN 1874-2718
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: heavy chain antibody * VHH * NMR resonance assignments
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 0.820, rok: 2013
Prosser, C. E.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0236182

0427728 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rana, D. N. - Chhabria, M. T. - Shah, N. K. - Brahmkshatriya, Pathik
Discovery of new antitubercular agents by combining pyrazoline and benzoxazole pharmacophores: design, synthesis and insights into the binding interactions.
Medicinal Chemistry Research. Roč. 23, č. 5 (2014), s. 2218-2228. ISSN 1054-2523
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antitubercular * benzoxazole * interaction energy * molecular docking * pharmacophore * pyrazoline
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 1.612, rok: 2012
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233309

0427628 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rana, D. N. - Chhabria, M. T. - Shah, N. K. - Brahmkshatriya, Pathik
Pharmacophore combination as a useful strategy to discover new antitubercular agents.
Medicinal Chemistry Research. Roč. 23, č. 1 (2014), s. 370-381. ISSN 1054-2523
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antitubercular * benzoxazole * interaction energy * molecular docking * pharmacophore * pyrazoline
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 1.612, rok: 2012
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233163

0429742 - UOCHB-X 2015 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Rosenberg, Ivan
Chemie fosfonátových analogů nukleotidů a oligonukleotidů - stručná reminiscence a současnost.
[Chemistry of Phosphonate Analogs of Nucleotides and Oligonucleotides - Brief Reminiscence and the Present.]
Chemické listy. Roč. 108, č. 4 (2014), s. 375-386. ISSN 0009-2770
Grant CEP: GA ČR GA13-26526S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: oligonucleotides * phosphonates * RNase H * RNase L
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 0.196, rok: 2013
Rosenberg, Ivan
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234805

0429635 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Rumlová, Michaela - Křížová, Ivana - Keprová, Alena - Hadravová, Romana - Doležal, Michal - Strohalmová, Karolína - Pichová, Iva - Hájek, Miroslav - Ruml, T.
HIV-1 protease-induced apoptosis.
Retrovirology. Roč. 11, May 20 (2014), 37/1-37/15. ISSN 1742-4690
Grant CEP: GA ČR GA204/09/1388
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: HIV protease * BCA3 * AKIP-1 * apoptosis * mitochondria
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 4.767, rok: 2013
http://www.retrovirology.com/content/11/1/37
Rumlová, Michaela
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234752

0430010 - UOCHB-X 2015 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Růžička, Martin - Čížková, Martina - Jirásek, Michael - Teplý, Filip - Koval, Dušan - Kašička, Václav
Study of deoxyribonucleic acid-ligand interactions by partial filling affinity capillary electrophoresis.
Journal of Chromatography A. Roč. 1349, Jul (2014), s. 116-121. ISSN 0021-9673.
[ITP 2013. International Symposium on Electro- and Liquid Phase- Separation Techniques /20./. Puerto de la Cruz, 06.10.2013-09.10.2013]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP206/12/0453; GA ČR(CZ) GA13-17224S; GA ČR GA13-32974S; GA ČR GA13-19213S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: affinity capillary electrophoresis * stability constant * DNA * ethidium bromide * oligophenylene derivatives * partial filling
Kód oboru RIV: CB - Analytická chemie, separace
Impakt faktor: 4.258, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0235047

0429925 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ryerson, J. L. - Schrauben, J. N. - Ferguson, A. J. - Sahoo, S. C. - Naumov, P. - Havlas, Zdeněk - Michl, Josef - Nozik, A. J. - Johnson, J. C.
Two Thin Film Polymorphs of the Singlet Fission Compound 1,3-Diphenylisobenzofuran.
Journal of Physical Chemistry C. Roč. 118, č. 23 (2014), s. 12121-12132. ISSN 1932-7447
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: exciton fission * electronic structure * optical properties
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.835, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234958

0427930 - UOCHB-X 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Řehoř, Ivan - Šlegerová, Jitka - Kučka, Jan - Proks, Vladimír - Petráková, Vladimíra - Adam, M.-P. - Treussart, F. - Turner, S. - Bals, S. - Šácha, Pavel - Ledvina, Miroslav - Wen, A. M. - Steinmetz, N. F. - Cígler, Petr
Fluorescent Nanodiamonds Embedded in Biocompatible Translucent Shells.
Small. Roč. 10, č. 6 (2014), s. 1106-1115. ISSN 1613-6810
Grant CEP: GA ČR GAP108/12/0640; GA MŠk(CZ) LH11027; GA ČR GBP208/12/G016
Grant ostatní: Seventh Framework Program(XE) FP7-262348; OPPK(XE) CZ.2.16/3.1.00/24016; OP VK(XE) CZ.1.07/2.3.00/20.0306
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61389013 ; RVO:68378271 ; RVO:61389005
Klíčová slova: biocompatibilization * fluorescent nanodiamonds * nanoparticles
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie; CD - Makromolekulární chemie (UMCH-V)
Impakt faktor: 7.514, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233505

0429976 - UOCHB-X 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Řehoř, Ivan - Macková, Hana - Fillipov, Sergey - Kučka, Jan - Proks, Vladimír - Šlegerová, Jitka - Turner, S. - van Tendeloo, G. - Ledvina, Miroslav - Hrubý, Martin - Cígler, Petr
Fluorescent Nanodiamonds with Bioorthogonally Reactive Protein-Resistant Polymeric Coatings.
ChemPlusChem. Roč. 79, č. 1 (2014), s. 21-24. ISSN 2192-6506
Grant CEP: GA ČR GAP108/12/0640; GA MŠk(CZ) LH11027
Grant ostatní: OPPK(CZ) CZ.2.16/3.1.00/24016; Seventh Framework Programme of the European Union(XE) FP7-262348; European Research Council(XE) FP7-246791
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61389013 ; RVO:61389005
Klíčová slova: click chemistry * fluorescence * nanoparticles * polymerization * solubilization
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie; CD - Makromolekulární chemie (UMCH-V)
Impakt faktor: 3.242, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0235046

0427605 - UOCHB-X 2015 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Řehoř, Ivan - Macháčková, L. - Bučánková, A. - Matějková, Stanislava - Černá, K. - Straka, J.
Measuring the sugar consumption of larvae in bumblebee micro-colonies: a promising new method for tracking food economics in bees.
Apidologie. Roč. 45, č. 1 (2014), s. 116-128. ISSN 0044-8435
Grant CEP: GA TA ČR TA01020969
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GAP506/10/0403
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: marking technique * lanthanide * carbohydrate * insect * ICP-OES
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 1.538, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233157

0429945 - UOCHB-X 2015 CH eng J - Článek v odborném periodiku
Řehoř, Ivan - Cígler, Petr
Precise estimation of HPHT nanodiamond size distribution based on transmission electron microscopy image analysis.
Diamond and Related Materials. Roč. 46, Jun (2014), s. 21-24. ISSN 0925-9635
Grant CEP: GA ČR GAP108/12/0640; GA MŠk(CZ) LH11027
Grant ostatní: OPPK(CZ) CZ.2.16/3.1.00/24016
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: TEM * nanoparticles * nanodiamonds * size distribution * high-pressure high-temperature * image analysis
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 1.572, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234973

0427704 - UOCHB-X 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Řehová, Lucie - Císařová, I. - Jahn, Ullrich
Divergent Reactivity of Alkyl Aryl Sulfones with Bases: Selective Functionalization of ortho-Aryl and alpha-Alkyl Units Enabled by a Unique Carbanion Transmetalation.
European Journal of Organic Chemistry. Roč. 2014, č. 7 (2014), s. 1461-1476. ISSN 1434-193X
Grant CEP: GA ČR GAP207/11/1598
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: sulfones * transmetalation * lithiation * deprotonation * alkylation * acidity
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 3.154, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233203

0430905 - UOCHB-X 2015 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Řehová, Lucie - Jahn, Ullrich
Elucidation of the Reaction Mechanism of ortho ->alpha Transmetalation Reactions of Alkyl Aryl Sulfone Carbanions.
European Journal of Organic Chemistry. Roč. 2014, č. 21 (2014), s. 4610-4623. ISSN 1434-193X
Grant CEP: GA ČR GAP207/11/1598
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: reaction mechanisms * transmetalation * lithiation * kinetics * isotopic labeling
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 3.154, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0235578

0431787 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - Hobza, Pavel
Ab Initio Quantum Mechanical Description of Noncovalent Interactions at Its Limits: Approaching the Experimental Dissociation Energy of the HF Dimer.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 10, č. 8 (2014), s. 3066-3073. ISSN 1549-9618
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Grant ostatní: Operational Program Research and Development for Innovations(XE) CZ 1.05/2.1.00/03/0058
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: correlated molecular calculations * gaussian basis set * water dimer
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 5.310, rok: 2013
Řezáč, Jan
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0236412

0427576 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sahoo, B. M. - Dinda, S. C. - Kumar, B. V. V. R. - Panda, J. - Brahmkshatriya, Pathik
Design, Green Synthesis, and Anti-Inflammatory Activity of Schiff Base of 1,3,4-oxadiazole Analogues.
Letters in Drug Design & Discovery. Roč. 11, č. 1 (2014), s. 82-89. ISSN 1570-1808
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: anti-inflammatory activity * design * green synthesis * oxadiazole * schiff base * spectroscopic studies
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 0.961, rok: 2013
Sahoo, B. M.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233143

0431029 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Sanchez-Sanz, G. - Trujillo, Cristina - Alkorta, I. - Elguero, J.
Intramolecular pnicogen interactions in phosphorus and arsenic analogues of proton sponges.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 16, č. 30 (2014), s. 15900-15909. ISSN 1463-9076
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: center dot N * correlated molecular calculations * electron density distribution
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.198, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0235747

0429649 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sedlák, Robert - Deepa, Palanisamy - Hobza, Pavel
Why Is the L-Shaped Structure of X-2 center dot center dot center dot X-2 (X = F, Cl, Br, I) Complexes More Stable Than Other Structures?.
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 118, č. 21 (2014), s. 3846-3855. ISSN 1089-5639
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Grant ostatní: Operational Program Research and Development for Innovations(XE) CZ 1.05/2.1.00/03/0058
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: distributed multipole analysis * density functional theory * consistent basis sets * correlated molecular calculations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.775, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234757

0429970 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Schimer, Jiří - Konvalinka, Jan
Unorthodox Inhibitors of HIV Protease: Looking Beyond Active-site-directed Peptidomimetics.
Current Pharmaceutical Design. Roč. 20, č. 21 (2014), s. 3389-3397. ISSN 1381-6128
Grant CEP: GA ČR GAP207/11/1798
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: proteinase * proteolytic processing * virostatic * rational drug design * resistance development
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.288, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234977

0429670 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Schmitt, A. - Perraud, O. - Payet, E. - Chatelet, B. - Bousquet, B. - Valls, M. - Padula, Daniele - Di Bari, L. - Dutasta, J. P. - Martinez, A.
Improved hemicryptophane hosts for the stereoselective recognition of glucopyranosides.
Organic & Biomolecular Chemistry. Roč. 12, č. 24 (2014), s. 4211-4217. ISSN 1477-0520
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: hydrogen-bonding receptors * molecular recognition * artificial receptors
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 3.487, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234775

0429549 - UOCHB-X 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Schrauben, J. N. - Ryerson, J. L. - Michl, Josef - Johnson, J. C.
Mechanism of Singlet Fission in Thin Films of 1,3-Diphenylisobenzofuran.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 136, č. 20 (2014), s. 7363-7373. ISSN 0002-7863
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: excimer forming crystal * exciton fission * tetracene
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 11.444, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234691

0429518 - UOCHB-X 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Siciliano, P. - He, X. L. - Woodcock, C. - Pickett, J. A. - Field, L. M. - Birkett, M. A. - Kalinová, Blanka - Gomulski, L. M. - Scolari, F. - Gasperi, G. - Malacrida, A. R. - Zhou, J. J.
Identification of pheromone components and their binding affinity to the odorant binding protein CcapOBP83a-2 of the Mediterranean fruit fly, Ceratitis capitata.
Insect Biochemistry and Molecular Biology. Roč. 48, May (2014), s. 51-62. ISSN 0965-1748
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: medfly * Ceratitis capitata * olfaction * odorant binding protein * pheromone binding protein * pheromone * binding studies * protein expression * electroantennography * GC-EAG * fluorescence displacement
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.420, rok: 2013
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234685