ÚvodPh.D. studium na ÚOCHBArchiv - 2009Fyzikální chemie

Fyzikální chemie

Školitel Doc. RNDr. Petr Bouř, CSc.
Skupina Petr Bouř
Téma Vývoj molekulové dynamiky pro transportní procesy
Fakulta MFF UK
Anotace

Molekulová dynamika umožňuje simulovat přírodní procesy na atomové úrovni. Dlouhou dobu byla omezena na modelování interakcí mezi molekulami. Mnoho důležitých jevů v chemii (elektroforéza, chromatografie) nebo v biologii (iontová výměna v buňkách, přenos nervového signálu) však vyžaduje speciální adaptace dynamických výpočtů, které nejsou součástí dostupných programů. Nedávno tak byla na ÚOCHB poprvé úspěšně simulována chirální separace molekul v kapalinové chromatografii. Cílem práce proto je adaptovat a modifikovat postupy a programy (převážně ve Fortranu a Pascalu) pro dlouhočasové simulace transportních dějů. Jako zcela nový prvek plánujeme zahrnutí vnějších polí do simulací. Simulace chromatografických dějů, zejména chirální separace, bude možné ověřit experimentálně.