Strukturovaný životopis:
| 1995-2000 |
magisterské studium VŠCHT, Praha (titul Ing.). Obor: biochemie
|
| 1998-2000 |
diplomant na ÚŽFG, AV ČR |
| 2000-2006 |
postgraduální studium na VŠCHT, Praha (titul Ph.D.). Obor: mikrobiologie |
| 2000-2006 |
doktorand na ÚŽFG, AV ČR
téma disertační práce: Ekologie anaerobních butyrát-produkujících bakterií
|
| 2006-2010 |
postdoktorandský výzkum na ÚŽFG, AV ČR |
| 2010-nyní |
vědecký pracovník na ÚŽFG, AV ČR
|
Specializace:
Hlavním pracovním zaměřením je popis diverzit anaerobních mikrobiálních společenstev (bakterií, archeí a hub) z trávicího traktu lidí a zvířat a sledování vztahu microbiom-hostitel. Řešená témata zahrnují studium mikrobiomu pacientů se zánětlivými onemocněními (Crohnova choroba, ulcerosní kolitida, primární sklerozující cholanditida), vliv terapie (fekální transplantace, transplantace jater) a také vliv potravinových doplňků na lidský mikrobiom (chitosan). Dalším zaměřením jsou výživové studie na chov hospodářských zvířat, kde zkoumáme vliv diety na složení mikroflóry trávicího traktu. V nedávné době jsme se také zaměřili na studium bakteriálního složení biomasy v bioplynových stanicích s cílem jejich modifikace pro větší produkci bioplynu. Dalším tématem je popis nových druhů bakterií a hub a jejich taxonomické zařazení.
K řešení těchto témat používáme metody molekulární biologie, které zahrnují PCR-DGGE, kvantitativní PCR, Sangerovo sekvenování a také sekvenování nové generace na platformě Ion Torrent.
Vědecké společnosti:
| |
Československá společnost mikrobiologická |
Zahraniční stáže:
| 2001-2002 |
Slovenská akademie věd, ÚFHZ, Košice, Slovensko |
| 2002 |
Ljubljanská univerzita, Biotechnologická fakulta, Domžale, Slovinsko |
| 2003-2003 |
Rowett Research Institute, Aberdeen, Velká Británie |
| 2008 |
Univerzita Aberystwyth, Aberystwyth, Velká Británie |
Zahraniční spolupráce:
University of Ljubljana, Domžale, Slovinsko: fylogeneze butyrát produkujících bakterií
Slovenská akademie věd, ÚFHG, Košice, Slovensko: restrikční endonukleázy butyrát produkujících bakterií
Rowet Research Institute, Aberdeen, Skotsko: přenos genů bakterií metodou přirozené transformace
Univerzita Aberystwyth, Wales: fylogeneze anaerobních hub
Univerzita Innsbruck, Rakousko: produkce bioplynu
Univerzita Mendoza, Argentina: mikrobiom trávicího traktu koz
Vybrané publikace:
| 2003 |
Kopečný J, Marinšek-Logar R, Zorec M, Mrázek J, Kobayashi Y (2003) Butyrivibrio hungatei sp. nov., and Pseudobutyrivibrio xylanivorans sp. nov., butyrate-producing bacteria from the rumen. Int J Syst Evol Micr 53 (1): 201-209
|
| 2005 |
Mrázek J., Piknová M., Pristaš P., Kopečný J.: Occurence of restriction-modification systems in ruminal butyrate-producing bacteria. Anaerobe 11:280-284. |
| 2008 |
Scott K.P., Martin J.C., Mrazek J., Flint H.J.: Transfer of conjugative elements from rumen and human Firmicutes bakteria to Roseburia inulinivorans. Appl Environ Microbiol. 74 (12):3915-3917. |
| |
Mrázek J., Štrosová L., Fliegerová K., Kott T., Kopečný J.: Diversity of Insect Intestinal Microflora. Folia Microbiol. 53 (3):229-233. |
| 2009 |
Killer J, Kopecny J, Mrázek J,Rada V, Benada O, Koppová I, Havlík J, Straka J (2009) Bifidobacterium bombi sp. nov., from the bumblebee digestive tract. Int J Syst Evol Micr 59 (8): 2020-2024
|
| 2010 |
Mrázek J., Koppová I., Kopečný J., Šimůnek J., Fliegerová K.: PCR-DGGE-based study of fecal microbial stability during the long-term chitosan supplementation of humans. Folia Microbiol. 55 (4):352-358. |
| 2011 |
Zakostelska Z, Kverka M, Klimesova K, Rossman P, Mrazek J, Kopecny J, Hornova M, Srutkova D, Hudcovic D, Ridl J, Tlaskalova-Hogenova H (2011) Lysate of probiotic Lactobacillus casei DN-114 001 ameliorates colitis by strengthening the gut barrier function and changing the gut microenvironment. PLoS ONE 6 (11) , art. no. e27961
|
| |
Kverka M., Zakostelska Z., Klimesova K., Sokol D., Hudcovic T., Hrncir T., Rossmann P., Mrazek J., Kopecny J., Verdu E.F., Tlaskalova-Hogenova H.: Oral administration of Parabacteroides distasonis antigens attenuates experimental murine colitis through modulation of immunity and microbiota composition. Clinical and Experimental Immunology. 163 (2):250-259. |
| 2012 |
Vlčková K, Mrázek J, Kopečný J, Petrželková KJ (2012) Evaluation of different storage methods to characterize the fecal bacterial communities of captive western lowland gorillas (Gorilla Gorilla Gorilla). J Microbiol Methods 91 (1): 45-51
|
| |
Prochazka J, Fliegerová K, Mrázek J, Štrosová L, Zábranská J, Dohányos M (2012) Enhanced biogas yield from energy crops with rumen anaerobic fungi. Eng Life Sci 12 (3): 343-351
|
| |
Michiels J, Skrivanova E, Missotten J, Ovyn A, Mrazek J, De Smet S, Dierick N (2012) Intact brown seaweed (Ascophyllum nodosum) in diets of weaned piglets: effects on performance, gut bacteria and morphology and plasma oxidative status. J Anim Phys Anim Nutr 96 (6): 1101-1111
|
| |
Čermáková J, Mrázek J, Fliegerová K, Tenkrát D (2012) Replacing natural gas by biogas - determining the bacterial contamination of biogas by PCR. Acta Polytech 52 (4): 33-38
|
| 2013 |
Klimesova K, Kverka M, Zakostelska Z, Hudcovic T, Hrncir T, Stepanova R, Rossmann P, Ridl J, Kostovcik M, Mrazek J, Kopecny J, Kobayashi KS, Tlaskalova-Hogenova H (2013) Altered gut microbiota promotes colitis-associated cancer in IL-1 receptor-associated kinase M-deficient mice. Inflam Bowel Dis. 19 (6): 1266-1277
|
| 2014 |
Fliegerova K, Tapio I, Bonin A, Mrazek J, Callegari ML, Bani P, Bayat A, Vilkki J, Kopecny J, Shingfield KJ, Boyer F, Coissac E, Taberlet P, Wallace JR (2014) Effect of DNA extraction and sample preservation method on rumen bacterial population. Anaerobe 29: 80-84
|
| |
Pechar R, Rada V, Parafati L, Musilova S, Bunesova V, Vlkova E, Mrazek J, Kmet V, Svejstil R (2014) Mupirocin-mucin agar for selective enumeration of Bifidobacterium bifidum. Int J Food Microbiol 191: 32-35
|
|
