projekty |
Profesní zaměření: | Director (Research Scientist) |
E-mail: | |
Pevná linka: | +420 267 090 502 |
Oddělení: | Laboratoř anaerobní mikrobiologie |
Budova: | Praha-Krč/39 |
Linka: | 12 |
Strukturovaný životopis:
Specializace: Anaerobní mikrobiologieVývoj laboratoře začal zaváděním mikrobiologických a biochemických metod pro anaeroby z trávicího traktu přežvýkavců. Pro jejich trávení mají největší význam mikroorganismy proteolytické, amylolytické a celulolytické. Po charakterizaci jejich enzymů jsem se věnoval adhezi mikrobů na částice krmiva, která rozhoduje o rychlosti a efektivitě trávení rostlinné hmoty. To vedlo k vývoji a aplikaci probiotik, genovým manipulacím anaerobních bakterií, k studiím interakcí anaerobů, enzymologii rozkladu rostlinné vlákniny a proteinů krmiva. Výsledkem byl i vývoj enzymových metod pro stanovení kvality krmiv. Podílel jsem se na vývoji transformačního vektoru pro bachorové bakterie zajišťujícího rozklad rostlinných toxinů. Vývoj a aplikace shuttle-vektoru s fluoroacetát dehalogenasou vedl k transformaci nepopsaných butyrát produkujících bakterií především izoláty příbuzné rodu Pseudobutyrivibrio. Vyvinutý transformační systém byl ve své době prvý funkční systém pro anaeroby. Transformace nepopsaných izolátů vedla k taxonomii butyrát produkujících bakterií a popisu dvou nových druhů: Butyrivibrio hungatei a Pseudobutyrivibrio xylanivorans. Po tom následovala účast na popisu druhu Butyrivibrio proteoclasticus a Eubacterium ovis. Znalost analýz butyrivibrií pomohly mapovat změny mikrobiomu u lidských pacientů s onemocněními střeva: Popsali jsme změny způsobené zánětlivými chorobami střeva (IBD, EC) a celiakií, stejně jako význam léčení probiotiky. Při studiích probiotik jsme popsali kolonizaci střeva bifidobakteriemi ve střevech novorozeňat a telat. Prokázali jsme přítomnost bifidobakterií u většiny obratlovců a některých druhů hmyzu. Při tom jsme popsali nové druhy bifidobakterií ve střevě čmeláků: Bifidobacterium bombi, B. bohemicum and B. actinicoloniformis a nový rod Bombiscardovia (Bombiscardovia coagulans). U svých hostitelů rovněž působí probioticky.
Vědecké společnosti:
Granty1. Tománková Eva, ČZU, Kopečný J., 2. Rada Vojtěch, ČZU, Kopečný J., 3. Tlaskalová Helena, MBÚ, Kopečný J., 4. Wallace R. John, Rowett (UK), Kopečný J., 5. Němečková Irena, MILCOM, Kopečný J., Vybrané publikace:Killer J., Kopečný J., Mrázek J., Rada V., Benada O., Koppová I., Havlík J., Straka J. Bifidobacterium bombi sp. nov., a new bifidobacterium from the bumblebee digestive tract. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 59 (8), 2020-2024, 2009 Killer J., Kopečný J., Mrázek J., Rada V., Dubna S., Marounek M. Bifidobacteria in the digestive tract of bumblebees. Anaerobe 16 (4), 165 – 170, 2010 Killer J., Kopečný J., Mrázek J., Havlík J., Koppová I., Benada O., Rada V. Bombiscardovia coagulans gen. nov., sp. nov., a new member of the family Bifidobacteriaceae isolated from the digestive tract of bumblebees Systematic and Applied Microbiology 33, 359-366, 2010 Kverka M., Zakostelska Z., Klimesova K., Sokol D., Hudcovic T., Hrncir T., Rossmann P., Mrazek J., Kopecny J., Verdu E., Tlaskalova-Hogenova H., Oral administration of Parabacteroides distasonis antigens attenuates experimental murine colitis through modulation of immunity and microbiota composition. Clinical and Experimental Immunology 163 (2), 250 – 259, 2011 Zákostelská Z., Kverka M., Klimešová K., Rossmann P., Mrázek J., Kopečný J., Hornová M., Šrutková D., Hudcovič T., Ridl J., Tlaskalová-Hogenová H., Lysate of probiotic Lactobacillus casei DN-114 001 ameliorates colitis by strengthening the gut barrier function and changing the gut microenvironment PLOS ONE 6 (11), e27961, 2011 Bunešová V., Domig K.J., Killer J., Vlková E., Kopečný J., Mrázek J., Ročková Š., Rada V. Characterization of bifidobacteria suitable for probiotic use in calves, Anaerobe 18, 166 – 168, 2012, Vlčková K., Mrázek J., Kopečný j., Petrželková K.J. Evaluation of different storage methods to characterize the fecal bacterial communities of captive western lowland gorillas (Gorilla gorilla gorilla). J. of Microbiological Methods, 91, 45 – 51, 2012 Killer J., Mrázek J., Bunešová V., Havlik J., Koppová I., Benada O., Rada V., Kopečný J., Vlková E., Pseudoscardovia suis gen. nov., sp. nov., a new member of the family Bifidobacteriaceae isolated from the digestive tract of wild pigs (Sus scrofa). Systematic & Applied Microbiol., 36, 11-16, 2013 Klimešová K., Kverka M., Zákostelecká Z., Hrnčíř T., Hudcovic T., Štěpánková R., Rossman P., Rídl J., Kostovčík M., Mrázek J., Kopečný J., Tlaskalová H., Altered Gut Microbiota Promotes Colitis-Associated Cancer in IL-1 Receptor–Associated Kinase M–Deficient Mice. Inflammatory Bowel Diseases,19, (6), 1266 – 1277, 2013 Killer J., Sedláček I., Rada V., Havlík J., Kopečný J., Reclassification of Bifidobacterium stercoris (Kim et al., 2010) as a later heterotypic synonym to Bifidobacterium adolescentis.International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2013 63 (11): 4350-4353; Killer J., Ročková S., Bunešová V., Vlková E., Rada V., Kopecny J., Havlik J., Koppová I, Benada O., Mrázek J., Kofronová O., Profousová I., Alloscardovia macacae sp. nov., isolated from the milk of macaque (Macaca mulatta), emended and revised description of the genus Alloscardovia. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 63 (12), 4439 – 46, 2013 Killer J., Švec P., Sedláček I., Černohlávková J., Benada O., Hroncová Z., Havlík J., Vlková E., Rada V., Kopečný J., Kofroňová O. Vagococcus entomophilum sp. nov., from the digestive tract of wasp (Vespula vulgaris) International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 64 (3), 731-737, 2014 Fliegerova K., Tapio I., Bonin A., Mrazek J., Callegari M.L., Bani P., Bayat A., Vilkki J., Kopečný J., Shingfield K.J., Boyer F., Coissac E., Taberlet P., Wallace R.J. Effect of DNA extraction and sample preservation method on rumen bacterial population Anaerobe, 29, 80 - 84, 2014 Killer J., Havlík J., Vlková E., Rada V., Pechar R., Benada O., Kopečný J., Kofroňová O., Sechovcová H. Lactobacillus rodentium sp. nov., from the digestive tract of wild rodents. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 64,(5), 1526 - 33, 2014 |
mapy.cz |
Liběchov Rumburská 89 277 21 Liběchov tel.: 315 639 532 fax: 315 639 510 |
Praha Vídeňská 1083 142 20 Praha 4-Krč tel.: 267 090 501 fax: 267 090 500 |
Brno Veveří 97 602 00 Brno 2 tel.: 532 290 136 fax: 541 212 988 matousova@iach.cz |