Skupina rentgenové strukturní analýzy se zabývá stanovováním atomární struktury krystalických látek a vývojem krystalografických výpočetních metod. Rentgenová difrakční data jsou hlavním zdrojem experimentálních údajů, ale výpočetní metody lze aplikovat i na data z neutronové či elektronové difrakce. Ve skupině je vyvíjen program Jana, který slouží k výpočtům a interpretaci struktur modulovaných, kompozitních a obecně komplikovaných krystalů.
