safar | Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Pracovní zařazení:

vědecký pracovník

Pracovní skupina:

Centrum strukturní a funkční genomiky rostlin

Publikace:

Počet publikací: 43

2015

The physical map of wheat chromosome 5DS revealed gene duplications and small rearrangements

Akpinar, B.A., Magni, F., Yuce, M., Lucas, S.J., Šimková, H., Šafář, J., Vautrin, S., Bergès, H., Cattonaro, F., Doležel. J., Budak, H.
BMC GENOMICS 16 453 2015 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
A high-resolution physical map integrating an anchored chromosome with the BAC physical maps of wheat chromosome 6B

Kobayashi, F., Wu, J., Kanamori, H., Tanaka, T., Katagiri, S., Karasawa, W., Kaneko, S., Watanabe, S., Sakaguchi, T., Hanawa, Y., Fujisawa, H., Kurita, K., Abe, C., Iehisa, J.C.M., Ohno, R., Šafář, J., Šimková, H., Mukai, Y., Hamada, M., Saito, M., Ishikawa, G., Katayose, Y., Endo, T.R., Takumi, S., Nakamura, T., Sato, K., Ogihara, Y., Hayakawa, K., Doležel, J., Nasuda, S., Matsumoto, T., Handa, H.
BMC GENOMICS 16 595 2015 Fulltext: PDF link pouze na intranetu

2014

Can a late bloomer become an early bird? Tools for flowering time adjustment

Milec, Z., Valárik, M., Bartoš, J., Šafář, J.
BIOTECHNOLOGY ADVANCES 32 200-214 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
The Wheat Black Jack: Advances towards sequencing the 21 chromosomes of bread wheat

Choulet, F., Caccamo, M., Wright, J., Alaux, M., Šimková, H., Šafář, J., Leroy, P., Doležel, J., Rogers, J., Eversole, K., Feuillet, C.
Genomics of plant genetic resources 405-438 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Structural and functional partitioning of bread wheat chromosome 3B

Choulet, F., Alberti, A., Theil, S., Glover, N., Barbe, V., Daron, J., Pingault, L., Sourdille, P., Couloux, A., Paux, E., Leroy, P., Mangenot, S., Guilhot, N., Le Gouis, J., Balfourier, F., Alaux, M., Jamilloux, V., Poulain, J., Durand, C., Bellec, A., Gaspin, C., Šafář, J., Doležel, J., Rogers, J., Vandepoele, K., Aury, JM., Mayer, K., Berges, H., Quesneville, H., Wincker, P., Feuillet, C.
SCIENCE 345(6194) 1249721 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Expression response of duplicated metallothionein 3 gene to copper stress in Silene vulgaris ecotypes

Nevrtalova, E., Baloun, J., Hudzieczek, V., Cegan, R., Vyskot, B., Doležel, J., Šafář, J., Milde, D., Hobza, R.
PROTOPLASMA 251 1427-1439 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
Whole-genome profiling and shotgun sequencing delivers an anchored, gene-decorated, physical map assembly of bread wheat chromosome 6A

Poursarebani, N., Nussbaumer, T., Šimková, H., Šafář, J., Witsenboer, H., van Oeveren, J., Doležel, J., Mayer, K.F.X., Stein, N., Schnurbusch, T.
PLANT JOURNAL 79 334-347 2014 Fulltext: PDF link pouze na intranetu

2013

Physical mapping integrated with syntenic analysis to characterize the gene space of the long arm of wheat chromosome 1A.

Lucas, S.J., Akpınar, B.A., Kantar, M., Weinstein, Z., Aydınoglu, F., Šafář, J., Šimková, H., Frenkel, Z., Korol, A., Magni, F., Cattonaro, F., Vautrin, S., Bellec, A., Berges, H., Doležel, J., Budak, H.
PLoS ONE 8 e59542 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
A high density physical map of chromosome 1BL supports evolutionary studies, map-based cloning and sequencing in wheat

Philippe, R., Paux, E., Bertin, I., Sourdille, P., Choulet, F., Laugier, C., Šimková, H., Šafář, J., Bellec, A., Vautrin, S., Frenkel, Z., Cattonaro, F., Magni, F., Scalabrin, S., Martis, M.M., Mayer, K.F.X., Korol, A., Bergès, H., Doležel, J., Feuillet, C.
GENOME BIOLOGY 14 R64 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu
A physical map of the short arm of wheat chromosome 1A

Breen, J., Wicker, T., Shatalina, M., Frenkel, Z., Bertin, I., Philippe, R., Spielmeyer, W., Šimková, H., Šafář, J., Cattonaro, F., Scalabrin, S., Magni, F., Vautrin, S., Berges, H., International Wheat Genome Sequencing Consortium, Paux, E., Fahima, T., Doležel, J., Korol, A., Feuillet, C., Keller, B.
PLoS ONE 8 e80272 2013 Fulltext: PDF link pouze na intranetu

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
poznáváme svět rostlin

RNDr. Jan Šafář, Ph.D.

Profile

2015

2014

2013

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i. poznáváme svět rostlin

RNDr. Jan Šafář, Ph.D.

Profile

2015

2014

2013

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
poznáváme svět rostlin