Koncem roku 1999 byla podepsána smlouva „ Contract of Association between the European Atomic Energy Community (EURATOM) and the Institute of Plasma Physics " , jejímž cílem je integrovat ČR do evropského výzkumu řízené termojaderné fúze. Tímto aktem byla vytvořena tzv. Association EURATOM - IPP.CR , která koordinuje český výzkum v oblasti jaderného slučování a mezinárodní spolupráci s dalšími 27 asociacemi.
Byl ustaven Řídící výbor asociace ("Steering Committee"), který je složen ze tří zástupců ČR a tří zástupců bruselské administrativy (EURATOM). Tento výbor schvaluje složení Asociace, plán práce, dosažené výsledky, výroční zprávy atd. Na formování vědeckého programu Asociace se podílí Mezinárodní poradní výbor Asociace ( International Board of Advisors ), tvořený devíti předními evropskými experty v oblasti řízeného termojaderného slučování, který zasedá jednou ročně v Praze.
V návaznosti na asociační smlouvu byly postupně podepsány další doplňující smlouvy:
- European Fusion Developement Agreement (EFDA), jejímž účelem je koordinace fúzního výzkumu mezi národními laboratořemi, organizace výzkumu vznikajících technologií a zajištění společného využívání tokamaku JET;
- Agreement on Promotion of Staff Mobility in the field of Controlled Thermonuclear Fusion, poskytující finanční podporu při výměně vědeckých pracovníků mezi Asociacemi a při účasti na koordinačních poradách EFDA;
- JET Implementing Agreement, která zajisťuje účast českých vědců na výzkumném programu největšího evropského tokamaku JET;
- HPC Implementing Agreement, která zajišťuje využívání evropského superpočítače určeného pro fúzní výzkum (European High Performance Computer for Fusion Applications, HPC-FF) instalovaného v německém výpočetním středisku JSC v Jülichu.
