Akademie věd ČR › Věda a výzkum › Významné a zajímavé projekty › Oblast věd o živé přírodě a chemických věd
Funkční genomika a skríning cDNA a genomové knihovny chmelu (Humulus lupulus L.) pro izolaci genů determinujících vývoj chmelových hlávek a produkci lupulinu
Abstrakt (v českém jazyce): Projekt navazuje na originální výsledky oddělení molekulární genetiky BC AV ČR ÚMBR, kde byly v uplynulých letech odhaleny geny kodeterminující některé ozdravné látku chmelu (Obr.1). Hlavním vědeckým cílem stávajícího projektu je studium molekulárních aspektů procesu zrání samičích květenství chmele (Hululus lupulus L.), chmelových hlávek. Z jedné strany má projekt za cíl přispět k obecnému pochopení molekulárních procesů při buněčné diferenciaci a diferenciaci pletiv během vývoje chmelových hlávek a ze strany druhé má toto poznání jasný praktický dopad, jelikož žláznaté trichomy chmelu produkují jako součást zrajících chmelových hlávek důležité sekundární metabolity. Těmito sekundárními metabolity jsou prenylované flavonoidy (Obr.2) mající potenciální protirakovinný účinek a hořké kyseliny, jež se používají pro výrobu piva. Pro identifikaci genů, jež determinují vývoj chmelových hlávek, je využívána techniky cDNA AFLP. Pomocí této techniky jsou připravovány a porovnávány elektroforetické profily fragmentů cDNA z hlávek různých stádií i genotypů a tím bude možné rozlišit diferenciálně se exprimující transkripty RNA. Odpovídající fragmenty cDNA jsou následně isolovány a sekvenovány. Následně provádíme skríning specifických cDNA a genomové knihovny chmele s cílem identifikace kompletních cDNA a uplných sekvencí specifických chmelových genů. Projekt je řešen ve splupráci partnery z Belgie (Universita v Ghentu) kde již byly získány předběžné výsledky pomocí cDNA AFLP, na základě kterých započal uvedený skríning knihoven které byly připraveny na oddělení molekulární genetiky ÚMBR AV ČR.
KONTAKTNÍ OSOBA:
Jaroslav Matoušek, CSc.
e-mail:
Biologické centrum AV ČR, Ústav molekulární biologie rostlin
