Metabolický syndrom je definován jako současný výskyt několika rizikových faktorů diabetu 2. typu a kardiovaskulárních chorob; jedná se hlavně o obezitu, inzulinovou rezistenci, vysoké hladiny triglyceridů a LDL cholesterolu a hypertenzi. Tyto rizikové faktory jsou podmíněny mnoha geny s malými účinky a jejich interakcemi s faktory prostředí. Celogenomové asociační studie u velkých souborů pacientů a kontrol, založené na hypotéze „běžné polymorfizmy – běžné choroby“, zatím odhalily jen malou část heritability komplexních patofyziologických znaků.
Statisticky významné varianty jsou typicky asociované s nepatrnou fenotypickou variabilitou bez klinické relevance. Analýzy zvířecích modelů lidských komplexních chorob tak mohou představovat užitečnou alternativu, neboť umožňují kontrolu genetického pozadí a faktorů prostředí a genetické manipulace experimentálních zvířat pro in vivo funkční studie. Spontánně hypertenzní potkani kmene SHR jsou nejčastěji používaným modelem esenciální hypertenze a asociovaných metabolických poruch, typických pro metabolický syndrom. I když se nedá očekávat, že by metabolický syndrom byl podmíněn stejnými geny u potkanů a lidí, je pravděpodobné, že tyto geny budou součástí mezidruhově konzervovaných metabolických drah. Lze tedy předpokládat, že odhalení genů podmiňujících patofyziologické procesy na buněčné úrovni u potkana přispěje k lepšímu pochopení patogeneze a terapie obdobných chorob u lidí.
Výzkum našeho oddělení je zaměřen na tyto projekty:
- Odhalení genů regulujících hemodynamické a metabolické znaky u kmene SHR.
- Odhalení nových genů kódujících mitochondriální proteiny a analýza jejich úlohy v patogenezi metabolického syndromu.
- Vytváření nových zvířecích modelů s využitím vysoce efektivních metod transgeneze a inaktivace genů.
- Analýza úlohy zánětlivých procesů a oxidačního stresu v patogenezi metabolického syndromu
- a možnost farmakologických intervencí.
Současná grantová podpora.
Aktuální projekty
Během několika posledních let byly vyvinuty nové efektivní techniky pro transgenezi potkana a pro inaktivaci genů. Naše oddělení se podílelo na optimalizaci transgeneze pomocí transpozonových vektorů Sleeping Beauty.
Více
Genetické analýzy komplexních patofyziologických znaků u rekombinantních inbredních (RI) kmenů umožňují využít dostupných genotypů a mnoha intermediárních fenotypů. Tyto intermediární fenotypy jsou jednodušeji geneticky podmíněny a mohou tak být využity pro spojení variability na úrovni DNA s komplexními patofyziologickými znaky. Mezi nejčastěji používané intermediární fenotypy patří profily genové exprese (transkriptom), variabilita v množství proteinů (proteom), metabolitů (metabolom), atd.
Více
Kandidátní geny pro patofyziologické znaky, odhalené pomocí vazebných a korelačních analýz s intermediárními fenotypy a jejich sekvenací, jsou analyzovány pomocí genetických modifikací s cílem získat definitivní důkazy pro jejich kauzální úlohu při determinaci patofyziologických znaků a odhalit mechanizmy jejich účinku.
Více
Mitochondrie hrají důležitou úlohu v patogenezi řady chorob. Funkce většiny mitochondriálních proteinů není známá. Cílem projektu je nalezení nových mitochondriálních proteinů, jejich funkce a úlohy v patogenezi metabolických poruch u potkana.
Více
Publikace
Trnovská, J. - Šilhavý, Jan - Zídek, Václav - Šimáková, Miroslava - Mlejnek, Petr - Landa, Vladimír - Eigner, Sebastian - Eigner-Henke, Kateřina - Škop, V. - Oliyarnyk, O. - Kazdová, L. - Mráček, Tomáš - Houštěk, Josef - Pravenec, Michal
.
Gender-related effects on substrate utilization and metabolic adaptation in hairless spontaneously hypertensive rat
.
Physiological Research. 2015, Vol. 64, 1, p. 51-60
.
IF = 1.293
[ASEP]
Šilhavý, Jan - Zídek, Václav - Landa, Vladimír - Šimáková, Miroslava - Mlejnek, Petr - Oliyarnyk, O. - Malínská, H. - Kazdová, L. - Mancini, M. - Pravenec, Michal
.
Rosuvastatin ameliorates inflammation, renal fat accumulation, and kidney injury in transgenic spontaneously hypertensive rats expressing human C-reactive protein
.
Physiological Research. 2015, Vol. 64, 3, p. 295-301
.
IF = 1.293
[ASEP]
Schafer, S. - Adami, E. - Heinig, M. - Rodrigues, K. E. C. - Kreuchwig, F. - Šilhavý, Jan - van Heesch, S. - Simaite, D. - Rajewsky, N. - Cuppen, E. - Pravenec, Michal - Vingron, M. - Cook, S. A. - Hubner, N.
Translational regulation shapes the molecular landscape of complex disease phenotypes
.
Nature Communications. 2015, Vol. 6, -, p. 7200
.
IF = 11.470
[ASEP]
[
doi
]
Kurtz, T. W. - Dominiczak, A. F. - DiCarlo, S. E. - Pravenec, Michal - Morris Jr., R. C.
Molecular-Based Mechanisms of Mendelian Forms of Salt-Dependent Hypertension Questioning the Prevailing Theory
.
Hypertension. 2015, Vol. 65, 5, p. 932-941
.
IF = 6.480
[ASEP]
[
doi
]
Heinig, M. - Colomé-Tatché, M. - Taudt, A. - Rintisch, C. - Schafer, S. - Pravenec, Michal - Hubner, N. - Vingron, M. - Johannes, F.
histoneHMM: Differential analysis of histone modifications with broad genomic footprints
.
B M C Bioinformatics. 2015, Vol. 16, Feb 22, p. 60
.
IF = 2.576
[ASEP]
[
doi
]
Zobrazit více