Snímek embryonálního myšího srdce z optického tomografu, model kapilár složený z více konfokálních snímků potkaního mozku a snímek mozku bažanta pořízený magnetickou rezonancí.
Zabýváme se hlavně pořizováním a měřením 3D mikroskopických i makroskopických obrazů biologických objektů – buněčné ultrastruktury, buněk, tkání nebo pletiv, orgánů i celých organismů. Vyvíjíme nové metody hodnocení včetně počítačové implementace.
Hlavní směry našeho výzkumu jsou:
- trojrozměrná analýza obrazu, stereologie, prostorová statistika, trojrozměrné rekonstrukce
- stereologické metody 1. a 2. řádu: studium rozptylu metod, vývoj nových metod a softwaru, konzultace, školení
- 3D mikroskopie biologických vzorků:
- konfokální a dvoufotonová mikroskopie: analýza dat, aplikace moderních fluorescenčních metod a metod dvoufotonové mikroskopie, kalibrační měření, dekonvoluce, obsluha a údržba dvoufotonového mikroskopu Leica SP AOBS a konfokálních mikroskopů Leica SPE, konzultace, školení
- optická projekční tomografie, fluorescenční a transmisní snímání submakroskopických vzorků, projasňování vzorků
Studujeme například anatomii ptačího mozku, převodní systémy srdce, kapiláry lidské placenty, potkaního svalu a mozku, vnitřní stavbu jehlic smrku a buněčné komponenty, např. jaderné struktury a endoplazmatické retikulum.
Aktuální projekty
Pomocí zobrazení s vysokým rozlišením a geometrické morfometrie studujeme vztah anatomie mozku a letových schopností ptáků, abychom umožnili interpretaci paleontologických nálezů neurokranií theropodních dinosaurů.
Více
K analýze převodního systému srdečního a jeho vývoje u myši používáme 3D zobrazovací metody a optické mapování.
Více
Na úrovni ultrastruktury chloroplastu zkoumáme vliv zvýšené koncentrace CO2 a ozářenosti na strukturu a funkci fotosyntetického aparátu dřevin.
Více
Krevní vlásečnice studujeme pomocí metod stereologie a 3D analýzy obrazu.
Více
Úspěchy
Publikace
Vyklický, Vojtěch - Krausová, Barbora - Černý, Jiří - Balík, Aleš - Zápotocký, Martin - Novotný, M. - Lichnerová, Katarina - Smejkalová, Tereza - Kaniaková, Martina - Kořínek, Miloslav - Petrovič, Miloš - Kačer, P. - Horák, Martin - Chodounská, Hana - Vyklický ml., Ladislav
.
Block of NMDA receptor channels by endogenous neurosteroids: implications for the agonist induced conformational states of the channel vestibule
.
Scientific Reports. 2015, Vol. 5, Jun 18, p. 10935
.
IF = 5.578
[ASEP]
[
doi
]
Roubalová, Lenka - Vošahlíková, Miroslava - Brejchová, Jana - Sýkora, Jan - Rudajev, Vladimír - Svoboda, Petr
.
High Efficacy but Low Potency of delta-Opioid Receptor-G Protein Coupling in Brij-58-Treated, Low-Density Plasma Membrane Fragments
.
PLoS ONE. 2015, Vol. 10, 8, e0135664
.
IF = 3.234
[ASEP]
[
doi
]
Lišková, Jana - Babchenko, Oleg - Varga, Marián - Kromka, Alexander - Hadraba, Daniel - Švindrych, Zdeněk - Burdíková, Zuzana - Bačáková, Lucie
.
Osteogenic cell differentiation on H-terminated and O-terminated nanocrystalline diamond films
.
International Journal of Nanomedicine. 2015, Vol. 10, 2015, p. 869-884
.
IF = 4.383
[ASEP]
[
doi
]
Kubínová, Lucie - Janáček, Jiří
.
Confocal stereology: an efficient tool for measurement of microscopic structures
.
Cell and Tissue Research. 2015, Vol. 360, 1, p. 13-28
.
IF = 3.565
[ASEP]
[
doi
]
Cvetko, E. - Čapek, Martin - Damjanovska, M. - Reina, M. A. - Eržen, I. - Stopar-Pintarič, T.
The utility of three-dimensional optical projection tomography in nerve injection injury imaging
.
Anaesthesia. 2015, Vol. 70, 8, p. 939-947
.
IF = 3.382
[ASEP]
[
doi
]
Zobrazit více
A: Laserový konfokální mikroskop Leica SPE s jednofotonovou excitací. B: Laserový konfokální mikroskop Leica SP2 AOBS MP s jedno- i dvoufotonovou excitací.
