Organická chemie

Budou připravovány nové modifikované ribonukleosid trifosfáty a studovány jejich polymerasami katalyzované inkorporace do oligoribonukleotidů a RNA. Modifikace na bázi budou zahrnovat funkční skupiny různé velikosti i reaktivity, jakož i redoxní nebo fluorescenční značky. Bude studována stabilita těchto modifikovaných RNA vůči ribonukleásám a jejich využití v RNA interferenci a v RNA katalýze. Vybrané nukleotidy budou také využity v selekci aptamerů.

Klíčové citace:
1. Hocek, M.; Fojta, M. "Cross-coupling reactions of nucleoside triphosphates followed by polymerase incorporation. Construction and applications of base-functionalized nucleic acids" Org. Biomol. Chem. 2008, 6, 2233-2241.
2. Carthew, R. W.; Sontheimer, E. J. "Origins and Mechanisms of miRNAs and siRNAs" Cell, 2009, 136, 642-655.